More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2080 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  100 
 
 		 383 aa  783    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  66.67 
 
 		 380 aa  511  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  61.52 
 
 		 381 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  52.39 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  52.52 
 
 		 376 aa  393  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  52.91 
 
 		 376 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  51.59 
 
 		 377 aa  376  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  50.66 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  46.67 
 
 		 382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  45.13 
 
 		 382 aa  318  9e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  44.36 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  44.62 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  44.83 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  43.98 
 
 		 387 aa  295  7e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  43.57 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  42.04 
 
 		 383 aa  292  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  41.91 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  40.62 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  39.84 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  42.93 
 
 		 382 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  42.93 
 
 		 382 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  44.2 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  42.08 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  42.7 
 
 		 382 aa  273  5.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  38.99 
 
 		 382 aa  272  8.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  39.94 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  39.16 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  37.7 
 
 		 380 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  42.15 
 
 		 385 aa  265  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  41.64 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  41.64 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  35.75 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.53 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  39.78 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  39.07 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  38.94 
 
 		 363 aa  256  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  39.15 
 
 		 385 aa  255  7e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  38.64 
 
 		 381 aa  255  7e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  41.8 
 
 		 386 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  39.07 
 
 		 384 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  38.46 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  39.28 
 
 		 382 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  40.58 
 
 		 382 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  37.7 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  38.27 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  39.5 
 
 		 362 aa  249  8e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.5 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  39.5 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  36.44 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.8 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  37.34 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  39.28 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  38.62 
 
 		 381 aa  245  9e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  38.38 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  38.18 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  38.22 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  36.91 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  37.5 
 
 		 379 aa  232  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  39.22 
 
 		 401 aa  229  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  38.65 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  38.44 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  37.05 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  36.22 
 
 		 379 aa  219  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  38.89 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  35.75 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  34.36 
 
 		 385 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  34.36 
 
 		 385 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  36.71 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  36.79 
 
 		 391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  33.62 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  36.65 
 
 		 396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  37.86 
 
 		 392 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  33.9 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  38.8 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  38.8 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  34.11 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  34.29 
 
 		 396 aa  207  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  33.68 
 
 		 389 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  35.82 
 
 		 402 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  31.43 
 
 		 360 aa  206  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  36.05 
 
 		 373 aa  206  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  34.26 
 
 		 357 aa  206  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  36.96 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  34.99 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  33.89 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  36.34 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  36.65 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  31.27 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  35.4 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  36.08 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  36.65 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  34.03 
 
 		 412 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  34.2 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  33.98 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  33.7 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  34.35 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  33.25 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  35.75 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  35.2 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  34.17 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>