More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0386 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  100 
 
 
360 aa  723    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
400 aa  270  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  41.9 
 
 
383 aa  269  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  38.78 
 
 
362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  38.78 
 
 
362 aa  265  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.19 
 
 
362 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  38.14 
 
 
379 aa  258  9e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  38.07 
 
 
386 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  36.11 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  38.15 
 
 
381 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  38.87 
 
 
388 aa  252  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  36.97 
 
 
360 aa  252  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  40.62 
 
 
385 aa  252  7e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  35.71 
 
 
384 aa  249  6e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  35.71 
 
 
384 aa  247  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  37.36 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  37.57 
 
 
385 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
382 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  35.29 
 
 
384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  35.16 
 
 
380 aa  238  9e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  35.24 
 
 
379 aa  235  8e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  36.1 
 
 
387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  36.78 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.67 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  34.77 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  34.38 
 
 
379 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  34.1 
 
 
379 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  34.96 
 
 
387 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  33.33 
 
 
384 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  34.62 
 
 
382 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  38.01 
 
 
382 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  33.33 
 
 
395 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  34.73 
 
 
389 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  34.07 
 
 
382 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.07 
 
 
382 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  33.61 
 
 
385 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.99 
 
 
382 aa  223  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.1 
 
 
382 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  34.02 
 
 
382 aa  222  6e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  33.24 
 
 
382 aa  222  7e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  34.29 
 
 
380 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  33.71 
 
 
384 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  34.07 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  35.24 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.3 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  36.9 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  34.07 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  33.89 
 
 
391 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.93 
 
 
383 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  36.06 
 
 
394 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  33.05 
 
 
386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  31.94 
 
 
382 aa  210  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  32.22 
 
 
382 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  32 
 
 
385 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  35.5 
 
 
374 aa  206  4e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.43 
 
 
383 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  31.9 
 
 
397 aa  206  6e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  32.58 
 
 
382 aa  205  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  32.87 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  32.56 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  32.3 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  32.23 
 
 
377 aa  197  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  36.49 
 
 
390 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  31.79 
 
 
422 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  31.82 
 
 
377 aa  192  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  31.67 
 
 
412 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  30.99 
 
 
385 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.36 
 
 
380 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  30.99 
 
 
385 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  31.69 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  31.4 
 
 
391 aa  189  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  30.68 
 
 
381 aa  189  8e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  31.69 
 
 
391 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  29.91 
 
 
396 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  31.52 
 
 
401 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  32.28 
 
 
398 aa  186  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  31.4 
 
 
391 aa  186  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  30.81 
 
 
396 aa  186  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  31.5 
 
 
381 aa  182  6e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1887  Serine--pyruvate transaminase  31.2 
 
 
373 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  31.03 
 
 
406 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  30.23 
 
 
391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  31.23 
 
 
406 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  31.79 
 
 
397 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  30.94 
 
 
376 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  30.32 
 
 
387 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  30.19 
 
 
375 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  30.43 
 
 
397 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0174  aminotransferase class V  33.43 
 
 
360 aa  176  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  30.66 
 
 
406 aa  175  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  30.26 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  29.36 
 
 
396 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1674  aminotransferase, class V  33.13 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00211461  normal  0.187219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  30.46 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.58 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  30.37 
 
 
402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  31.32 
 
 
406 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  30.83 
 
 
384 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  30.92 
 
 
401 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  30.7 
 
 
397 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>