More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3452 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  100 
 
 
391 aa  802    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  70.6 
 
 
389 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  69.41 
 
 
389 aa  551  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  64.3 
 
 
394 aa  484  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  56.44 
 
 
395 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  60.63 
 
 
390 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  41.83 
 
 
380 aa  300  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  40.23 
 
 
380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  38.67 
 
 
379 aa  285  8e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  40.44 
 
 
384 aa  279  5e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  40.17 
 
 
384 aa  278  9e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  41.74 
 
 
379 aa  277  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  40.17 
 
 
380 aa  276  6e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  41.04 
 
 
379 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  35.64 
 
 
385 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  38.21 
 
 
382 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  38.94 
 
 
379 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  38.21 
 
 
382 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  39.88 
 
 
379 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  37.19 
 
 
382 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  36.6 
 
 
385 aa  258  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  36.54 
 
 
384 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  37.25 
 
 
386 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  40.11 
 
 
386 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  37.98 
 
 
383 aa  255  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  37.98 
 
 
385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  34.34 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  34.34 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  38.83 
 
 
388 aa  252  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  37.18 
 
 
360 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  36.75 
 
 
363 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  37.95 
 
 
395 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  36.68 
 
 
397 aa  249  6e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  41.24 
 
 
383 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  38.26 
 
 
362 aa  247  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  37.13 
 
 
382 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  35.36 
 
 
387 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.01 
 
 
387 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  38.55 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.35 
 
 
387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.55 
 
 
362 aa  246  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  36.41 
 
 
382 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  38.59 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  39.44 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  35.36 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.19 
 
 
400 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  35.8 
 
 
374 aa  237  2e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  33.05 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  33.92 
 
 
384 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  34.44 
 
 
381 aa  227  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  38.27 
 
 
375 aa  226  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  37.91 
 
 
382 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  34.59 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  33.89 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  33.89 
 
 
360 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  32.51 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  35.42 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.49 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  32.77 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.62 
 
 
383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  35.46 
 
 
377 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  32.77 
 
 
382 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  37.05 
 
 
376 aa  210  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  33.52 
 
 
387 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  37.71 
 
 
376 aa  206  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.15 
 
 
380 aa  206  6e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  32.5 
 
 
387 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  31.64 
 
 
385 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  31.64 
 
 
385 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  35.98 
 
 
381 aa  202  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  34.53 
 
 
391 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  33.83 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0073  aminotransferase, class V  34.57 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  33.89 
 
 
391 aa  196  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1929  aminotransferase class V  34.94 
 
 
370 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  34.87 
 
 
398 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  34.38 
 
 
396 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  34.09 
 
 
396 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  34.65 
 
 
402 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  33.72 
 
 
396 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  35.29 
 
 
377 aa  186  7e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  33.24 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  32.84 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  34.21 
 
 
389 aa  184  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  33.24 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  36.54 
 
 
400 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  35.33 
 
 
396 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0190  alanine--glyoxylate transaminase  32.8 
 
 
384 aa  180  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0814206  normal  0.663999 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.88 
 
 
394 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.24 
 
 
366 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  36.78 
 
 
403 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.59 
 
 
394 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  33.33 
 
 
417 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  32.49 
 
 
402 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  32.49 
 
 
402 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  35.57 
 
 
401 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  32.21 
 
 
402 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  32.87 
 
 
421 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  32.88 
 
 
376 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>