More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2128 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  100 
 
 		 391 aa  805    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  74.6 
 
 		 393 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  72.89 
 
 		 393 aa  604  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  67.45 
 
 		 413 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  69.73 
 
 		 376 aa  555  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  67.92 
 
 		 378 aa  545  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  66.94 
 
 		 377 aa  544  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  68.46 
 
 		 377 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  68.19 
 
 		 377 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  68.19 
 
 		 377 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  67.92 
 
 		 377 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  67.3 
 
 		 375 aa  541  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  68.11 
 
 		 377 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  67.65 
 
 		 377 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  67.39 
 
 		 377 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  66.04 
 
 		 373 aa  537  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  66.22 
 
 		 380 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  65.5 
 
 		 382 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  67.92 
 
 		 377 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  65.95 
 
 		 380 aa  528  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  63.98 
 
 		 373 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  66.22 
 
 		 380 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  63.96 
 
 		 369 aa  524  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  64.71 
 
 		 380 aa  522  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  66.31 
 
 		 373 aa  521  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  64.44 
 
 		 379 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  63.88 
 
 		 378 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  64.15 
 
 		 372 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  62.39 
 
 		 344 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  54.37 
 
 		 371 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  53.87 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  50.26 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  51.95 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  48.21 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  52.55 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  50.81 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  52.55 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  51.94 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  49.86 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  49.04 
 
 		 412 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  48.02 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  49.59 
 
 		 412 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  50.14 
 
 		 381 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  51.27 
 
 		 375 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.84 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  50.71 
 
 		 375 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  47.66 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.04 
 
 		 381 aa  352  8.999999999999999e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.46 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.08 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.29 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  44.29 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  44.54 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  54.7 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  42.97 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  48.2 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  45.11 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.68 
 
 		 389 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  37.75 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  38.31 
 
 		 412 aa  282  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  36.5 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  37.13 
 
 		 455 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  36.72 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  39.78 
 
 		 376 aa  272  9e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  37.5 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  35.48 
 
 		 410 aa  265  7e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  36.34 
 
 		 451 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  37.8 
 
 		 382 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  36.43 
 
 		 441 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  38.04 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  36.36 
 
 		 413 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  36.16 
 
 		 414 aa  255  7e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  35.66 
 
 		 414 aa  255  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  38.07 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  35.41 
 
 		 414 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.53 
 
 		 382 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  35.75 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  37.53 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  35.71 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  35.09 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  36.27 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  35.22 
 
 		 384 aa  245  8e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  38.74 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  34.51 
 
 		 418 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  33.94 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  33.6 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  34.15 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  32.47 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  34.38 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.67 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  35.34 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  35.34 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  34.83 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  34.22 
 
 		 384 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  33.78 
 
 		 385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 414 aa  216  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.95 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  33.16 
 
 		 387 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  34.15 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  34.15 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>