More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0212 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  100 
 
 		 414 aa  857    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  61.6 
 
 		 410 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  63.31 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2047  alanine--glyoxylate aminotransferase  63.05 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000188057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2556  aminotransferase class V  59.66 
 
 		 468 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3219  alanine--glyoxylate aminotransferase  63.05 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000141381  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3204  aminotransferase, class V  63.05 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2700  alanine--glyoxylate aminotransferase  63.05 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3165  aminotransferase, class V  63.05 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00663559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0866  alanine--glyoxylate aminotransferase  63.05 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000382013  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1910  alanine--glyoxylate aminotransferase  63.05 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0577107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0724  aminotransferase class V  62.63 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3920  aminotransferase, class V  62.44 
 
 		 403 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84351  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0344  aminotransferase, class V  62.37 
 
 		 403 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0707  aminotransferase, class V  62.63 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0828  aminotransferase, class V  62.37 
 
 		 403 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0287206  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0797  aminotransferase class V  62.44 
 
 		 403 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2424  aminotransferase class V  61.92 
 
 		 406 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0791  aminotransferase class V  60.78 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.644742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  35.54 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  33.95 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  35.89 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.93 
 
 		 412 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.65 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  34.15 
 
 		 413 aa  226  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  35.11 
 
 		 366 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  33.99 
 
 		 381 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  33.05 
 
 		 388 aa  217  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  34.05 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 391 aa  216  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  35.56 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  33.79 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  33.61 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  34.54 
 
 		 380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  34.66 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  33.89 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  36.01 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  33.98 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  34.99 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  34.53 
 
 		 380 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  33.82 
 
 		 375 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.89 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  33.61 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.7 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  34.44 
 
 		 377 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  33.8 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  34.17 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.89 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  33.79 
 
 		 378 aa  205  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.24 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.88 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  33.89 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  34.17 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  33.24 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  34.07 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.89 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  33.61 
 
 		 377 aa  203  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.24 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.52 
 
 		 394 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  34.64 
 
 		 369 aa  202  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  34.29 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  33.24 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.05 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.95 
 
 		 394 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  34.12 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  33.24 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  35.47 
 
 		 372 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.38 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  33.61 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  31.58 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  32.07 
 
 		 367 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  32.08 
 
 		 382 aa  189  9e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.13 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.61 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  30.63 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  33.08 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  31.06 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.13 
 
 		 382 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  30.13 
 
 		 382 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  30.13 
 
 		 382 aa  176  9e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  29.69 
 
 		 383 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  31.08 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  28.35 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  30.17 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  29.46 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  30.85 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  28.8 
 
 		 380 aa  167  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  27.86 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  30.89 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  28.97 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  31.05 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  31.94 
 
 		 312 aa  163  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  30.73 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  30.1 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  30.64 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  30.49 
 
 		 382 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  30.49 
 
 		 382 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>