More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5312 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 371 aa  746    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  58.92 
 
 		 377 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  57.18 
 
 		 373 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  54.92 
 
 		 413 aa  431  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  57.46 
 
 		 373 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  55.46 
 
 		 375 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  56.68 
 
 		 376 aa  433  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  56.49 
 
 		 380 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  57.46 
 
 		 393 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  56.37 
 
 		 378 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  58.54 
 
 		 380 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  56.95 
 
 		 377 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  56.33 
 
 		 380 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  56.37 
 
 		 379 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  53.28 
 
 		 369 aa  425  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  56.62 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  56.01 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  56.4 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  54.37 
 
 		 391 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  56.68 
 
 		 377 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  56.68 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  56.4 
 
 		 377 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  56.68 
 
 		 377 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  55.21 
 
 		 373 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  55.68 
 
 		 380 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  58.31 
 
 		 372 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  56.4 
 
 		 377 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  56.13 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  56.68 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  52.33 
 
 		 344 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  52.05 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  52.96 
 
 		 395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  52.96 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  52.96 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  46.87 
 
 		 388 aa  335  7.999999999999999e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  48.06 
 
 		 370 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  51.39 
 
 		 392 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  46.87 
 
 		 401 aa  331  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.11 
 
 		 412 aa  329  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  44.57 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  44.78 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  45.78 
 
 		 404 aa  326  3e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  46.74 
 
 		 394 aa  325  6e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  47.01 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  45.45 
 
 		 381 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  45.92 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  43.87 
 
 		 381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.09 
 
 		 384 aa  319  5e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  46.18 
 
 		 375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  50.67 
 
 		 312 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  45.89 
 
 		 375 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  49.72 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  42.86 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  42.3 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  42.39 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  41.74 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.7 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  41.18 
 
 		 394 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  46.94 
 
 		 376 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  44.05 
 
 		 412 aa  269  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  39.53 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  39.05 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  35.86 
 
 		 410 aa  249  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  39.53 
 
 		 411 aa  245  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  38.56 
 
 		 455 aa  243  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  35.86 
 
 		 406 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  43.22 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  39.01 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  36.81 
 
 		 426 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  36.13 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  36.03 
 
 		 406 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  35.08 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  35.34 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  35.6 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  35.08 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  36.13 
 
 		 441 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  34.55 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  34.03 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  35.26 
 
 		 410 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  34.9 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  32.16 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  32.95 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  36.18 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  32.16 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  32.46 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.99 
 
 		 384 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  33.73 
 
 		 384 aa  192  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  34.63 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  31.58 
 
 		 414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  35.29 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.19 
 
 		 380 aa  189  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  33.15 
 
 		 363 aa  189  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.87 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  34.78 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.78 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  30.92 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  32.66 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  31.12 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  32.36 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.17 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>