More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1207 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  80.71 
 
 		 394 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  91.62 
 
 		 394 aa  751    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  100 
 
 		 394 aa  810    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  76.24 
 
 		 412 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  76.24 
 
 		 412 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  77.47 
 
 		 366 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  73.56 
 
 		 384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  65.89 
 
 		 394 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  66.4 
 
 		 394 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  66.14 
 
 		 394 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  64.08 
 
 		 394 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  64.29 
 
 		 381 aa  519  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  63.1 
 
 		 381 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  66.86 
 
 		 375 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  66.86 
 
 		 375 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  53.19 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  53.71 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  50.27 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  50.66 
 
 		 395 aa  362  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  47.84 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  50.85 
 
 		 367 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  50.95 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  50.95 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  49.06 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  49.87 
 
 		 380 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  47.2 
 
 		 413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  49.33 
 
 		 380 aa  353  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  47.71 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  48.25 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  51.52 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  49.05 
 
 		 376 aa  344  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  46.65 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  45.28 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  48.65 
 
 		 379 aa  341  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  46.05 
 
 		 382 aa  339  5.9999999999999996e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  48.49 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  46.34 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  47.59 
 
 		 380 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  46.85 
 
 		 375 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  47.71 
 
 		 372 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  47.06 
 
 		 380 aa  333  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.79 
 
 		 377 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  46.52 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  43.16 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  46.76 
 
 		 377 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  46.49 
 
 		 377 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  46.49 
 
 		 377 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  46.49 
 
 		 377 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.26 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  46.22 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.52 
 
 		 377 aa  323  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  47.48 
 
 		 344 aa  322  8e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  45.92 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  47.22 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.66 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  42.35 
 
 		 396 aa  305  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  38.25 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.51 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  40.15 
 
 		 455 aa  295  9e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  41.19 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  39.95 
 
 		 441 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  40.26 
 
 		 413 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  39.44 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  39.69 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  39.74 
 
 		 414 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  39.85 
 
 		 414 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  38 
 
 		 411 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  39.48 
 
 		 414 aa  278  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  35.81 
 
 		 410 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  38.48 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  37.22 
 
 		 409 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  36.79 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  38.93 
 
 		 412 aa  262  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  35.99 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  37.02 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  42.47 
 
 		 384 aa  242  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  41.58 
 
 		 312 aa  236  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  37.4 
 
 		 376 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  31.96 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  33.24 
 
 		 384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  38.22 
 
 		 371 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  33.89 
 
 		 414 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  32.95 
 
 		 384 aa  209  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  33.89 
 
 		 384 aa  209  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  37.61 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.55 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  32.55 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.86 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  35.9 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.61 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  33.53 
 
 		 387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  31.96 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  39.71 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.41 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  30.97 
 
 		 410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.16 
 
 		 387 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  34.2 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  34.97 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  32.87 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  35.84 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>