More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3795 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  100 
 
 
375 aa  764    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  98.4 
 
 
375 aa  756    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  77.6 
 
 
381 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  73.64 
 
 
381 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  73.45 
 
 
384 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  67.59 
 
 
366 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  67.71 
 
 
412 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  67.71 
 
 
412 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  67.03 
 
 
394 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  67.03 
 
 
394 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  65.48 
 
 
394 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  61.88 
 
 
394 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  61.88 
 
 
394 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  61.6 
 
 
394 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  60.77 
 
 
394 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  52.89 
 
 
367 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  53.19 
 
 
396 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  53.19 
 
 
395 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  53.19 
 
 
396 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  50 
 
 
388 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  51.79 
 
 
391 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  51.19 
 
 
378 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  51.25 
 
 
413 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  52.42 
 
 
380 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  53.15 
 
 
377 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  53.15 
 
 
377 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  52.99 
 
 
376 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  52.88 
 
 
377 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  53.85 
 
 
392 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  52.6 
 
 
377 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  50.14 
 
 
401 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  52.88 
 
 
377 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  52.6 
 
 
377 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  50.82 
 
 
380 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  48.77 
 
 
404 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  51.09 
 
 
373 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  52.33 
 
 
377 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  52.33 
 
 
377 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  51.09 
 
 
382 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  49.04 
 
 
373 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  51.09 
 
 
380 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  51.92 
 
 
372 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  50.27 
 
 
369 aa  361  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  50.54 
 
 
393 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  47.97 
 
 
396 aa  360  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  48.65 
 
 
378 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.65 
 
 
380 aa  359  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  50 
 
 
379 aa  358  7e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  50 
 
 
380 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  49.18 
 
 
377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  49.59 
 
 
393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  48.35 
 
 
375 aa  354  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  49.05 
 
 
373 aa  350  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  49.86 
 
 
344 aa  345  5e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  47.14 
 
 
371 aa  335  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  43.7 
 
 
455 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  47.11 
 
 
370 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.97 
 
 
389 aa  315  7e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  41.69 
 
 
412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  40.43 
 
 
415 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  39.89 
 
 
410 aa  293  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  40.26 
 
 
413 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  39.74 
 
 
406 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  39.63 
 
 
426 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  39.79 
 
 
406 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  39.06 
 
 
409 aa  290  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  40.32 
 
 
414 aa  288  9e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  39.89 
 
 
411 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  39.79 
 
 
414 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  40.58 
 
 
441 aa  285  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  39.26 
 
 
414 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  40.58 
 
 
451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  40.05 
 
 
414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  39.26 
 
 
418 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  38.42 
 
 
436 aa  272  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  41.18 
 
 
376 aa  272  7e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  45.12 
 
 
312 aa  256  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  40.16 
 
 
384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.67 
 
 
382 aa  244  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  34.56 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.06 
 
 
382 aa  229  7e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 
382 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  34.62 
 
 
384 aa  226  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  33.06 
 
 
382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  38.44 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  37.71 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  37.88 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  35.83 
 
 
385 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.79 
 
 
384 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  33.99 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  34.27 
 
 
384 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  35.8 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  36.18 
 
 
382 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  32.8 
 
 
404 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.42 
 
 
380 aa  212  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  32.59 
 
 
387 aa  211  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.71 
 
 
382 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  34.71 
 
 
382 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  35.36 
 
 
386 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  34.68 
 
 
383 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>