More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1551 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 393 aa  808    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  76.47 
 
 		 393 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  74.28 
 
 		 391 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  67.64 
 
 		 413 aa  551  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  70.27 
 
 		 377 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  70.27 
 
 		 377 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  70.27 
 
 		 377 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  72.13 
 
 		 376 aa  548  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  69.81 
 
 		 373 aa  546  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  69.46 
 
 		 378 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  70 
 
 		 377 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  68.56 
 
 		 375 aa  544  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  70 
 
 		 377 aa  545  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  70.54 
 
 		 380 aa  541  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  69.46 
 
 		 377 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  69.17 
 
 		 379 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  69.35 
 
 		 380 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  68.36 
 
 		 380 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  68.92 
 
 		 377 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  69.19 
 
 		 377 aa  529  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  67.29 
 
 		 380 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  66.67 
 
 		 377 aa  525  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  65.31 
 
 		 369 aa  527  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  65.5 
 
 		 382 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  63.88 
 
 		 373 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  64.96 
 
 		 373 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  65.5 
 
 		 378 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  63.61 
 
 		 372 aa  497  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  63.27 
 
 		 344 aa  475  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  57.46 
 
 		 371 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  57.18 
 
 		 388 aa  421  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  53.93 
 
 		 401 aa  413  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  56.11 
 
 		 367 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  55.47 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  51.29 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  56.25 
 
 		 396 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  56.25 
 
 		 396 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  54.73 
 
 		 392 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  49.87 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  49.87 
 
 		 412 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  49.33 
 
 		 394 aa  358  8e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  49.06 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  48.76 
 
 		 394 aa  356  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  49.04 
 
 		 381 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  46.83 
 
 		 366 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  49.01 
 
 		 375 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  48.44 
 
 		 375 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.81 
 
 		 384 aa  338  8e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  45.01 
 
 		 381 aa  337  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  42.56 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  51.48 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  53.77 
 
 		 312 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  49.72 
 
 		 370 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.01 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  42.82 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.09 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  45.68 
 
 		 380 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  41.73 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  41.83 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  38.67 
 
 		 415 aa  290  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  39.41 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  39.36 
 
 		 455 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  37.78 
 
 		 451 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  36.79 
 
 		 410 aa  275  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  36.7 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  37.78 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  36.54 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  41.69 
 
 		 376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  38.24 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  37.35 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  37.5 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  37.04 
 
 		 414 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  38.27 
 
 		 414 aa  258  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  37.04 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  36.61 
 
 		 414 aa  256  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  36.03 
 
 		 406 aa  243  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  36.41 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  38.21 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  33.68 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  37.21 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  37.21 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  35.68 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  33.6 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 384 aa  223  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.21 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  33.95 
 
 		 382 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  33.95 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  33.16 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  32.21 
 
 		 380 aa  216  8e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  31.17 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  33.79 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  34.29 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  35.06 
 
 		 382 aa  210  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  33.95 
 
 		 383 aa  209  9e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  35.52 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  31.51 
 
 		 385 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.15 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  35.92 
 
 		 386 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  32.63 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  32.64 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>