More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_07741 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  99.27 
 
 		 412 aa  849    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  100 
 
 		 412 aa  852    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  76.5 
 
 		 394 aa  631  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  79.67 
 
 		 366 aa  627  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  76.24 
 
 		 394 aa  629  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  73.96 
 
 		 394 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  68.41 
 
 		 394 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  68.15 
 
 		 394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  67.8 
 
 		 394 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  68.85 
 
 		 384 aa  548  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  66.58 
 
 		 394 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  62.63 
 
 		 381 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  65.71 
 
 		 375 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  62.2 
 
 		 381 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  67.55 
 
 		 375 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  49.46 
 
 		 388 aa  388  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  48 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  48.76 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  49.87 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  46.56 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  49.59 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  49.15 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  49.46 
 
 		 395 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  49.46 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  49.46 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  49.04 
 
 		 375 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  47.98 
 
 		 393 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  49.33 
 
 		 380 aa  352  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  50.69 
 
 		 392 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  50 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  48.4 
 
 		 376 aa  345  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.12 
 
 		 377 aa  345  7e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  48.3 
 
 		 373 aa  345  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  46.03 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  45.75 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.33 
 
 		 377 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  47.06 
 
 		 378 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  47.67 
 
 		 380 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  48.35 
 
 		 377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  48.6 
 
 		 380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  46.58 
 
 		 372 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  48.08 
 
 		 377 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  49.85 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  48.08 
 
 		 377 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  48.08 
 
 		 377 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  45.53 
 
 		 378 aa  332  9e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.79 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  47.53 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  44.2 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  45.45 
 
 		 380 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  45.11 
 
 		 371 aa  329  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  46.77 
 
 		 379 aa  328  7e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.33 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  43.8 
 
 		 396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  45.87 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.03 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.99 
 
 		 389 aa  296  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  38.56 
 
 		 414 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  36.27 
 
 		 455 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  37.73 
 
 		 413 aa  279  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  35.6 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  37.63 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  36.36 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  37.73 
 
 		 451 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  37.47 
 
 		 409 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  36.05 
 
 		 410 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  37.47 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  38.48 
 
 		 406 aa  270  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  36.94 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  36.36 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  34.96 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  36.24 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  35.6 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  37.17 
 
 		 426 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  34.53 
 
 		 418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  42.62 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  35.33 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  39.08 
 
 		 384 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.19 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  35.24 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  36.65 
 
 		 414 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  34.96 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.02 
 
 		 382 aa  222  8e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  36.15 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  36.13 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  34.11 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  35.26 
 
 		 371 aa  210  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  32.84 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  35.2 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  32.26 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  32.67 
 
 		 410 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  36.15 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  33.89 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  33.7 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  35.46 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  35.59 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  33.79 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.8 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  34.87 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.57 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>