More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2509 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  100 
 
 		 377 aa  776    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  69.02 
 
 		 413 aa  555  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  66.94 
 
 		 391 aa  543  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  69.21 
 
 		 393 aa  541  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  66.76 
 
 		 382 aa  532  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  67.48 
 
 		 376 aa  532  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  65.94 
 
 		 373 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  66.67 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  62.67 
 
 		 369 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  66.03 
 
 		 377 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  65.85 
 
 		 377 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  65.31 
 
 		 378 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  65.76 
 
 		 377 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  65.76 
 
 		 377 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  65.76 
 
 		 377 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  62.93 
 
 		 375 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  65.58 
 
 		 377 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  65.14 
 
 		 380 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  65.49 
 
 		 377 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  64.52 
 
 		 380 aa  511  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  65.85 
 
 		 377 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  65.94 
 
 		 372 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  63.69 
 
 		 373 aa  508  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  63.69 
 
 		 373 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  65.22 
 
 		 378 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  64.48 
 
 		 379 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  63.17 
 
 		 380 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  63.34 
 
 		 380 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  63.37 
 
 		 344 aa  475  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  58.92 
 
 		 371 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  55.99 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  51.36 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  52.69 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  52.96 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  52.96 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  50 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  48.53 
 
 		 404 aa  368  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  46.21 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  51.37 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  47.12 
 
 		 412 aa  345  6e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  47.12 
 
 		 412 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.28 
 
 		 381 aa  344  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  48.59 
 
 		 375 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  46.58 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  48.16 
 
 		 375 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.39 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  53.36 
 
 		 312 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  47.24 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.97 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.8 
 
 		 380 aa  326  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  44.11 
 
 		 366 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  41.92 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.66 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  41.64 
 
 		 394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  41.37 
 
 		 394 aa  318  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  40.82 
 
 		 394 aa  315  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  43.17 
 
 		 396 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.63 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  42.78 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  36.32 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  36.24 
 
 		 382 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  36.81 
 
 		 412 aa  249  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  34.94 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  35.62 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  35.62 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  34.11 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.62 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  35.75 
 
 		 411 aa  242  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  34.69 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  32.98 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  38.9 
 
 		 384 aa  235  8e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  34.82 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  35.58 
 
 		 418 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  34.55 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  34.55 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  35.05 
 
 		 414 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  34.79 
 
 		 414 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  35.15 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  34.28 
 
 		 414 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  34.28 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  32.81 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  34.01 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  33.77 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  34.63 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  32.21 
 
 		 406 aa  219  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  32.24 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  36.91 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.72 
 
 		 384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  36.68 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  36.68 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  35.79 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  33.05 
 
 		 380 aa  210  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  35.71 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  33.15 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  33.88 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  33.43 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  31.73 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  32.53 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  33.15 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  33.15 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>