More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1404 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1910  alanine--glyoxylate aminotransferase  97.52 
 
 
404 aa  790    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0577107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0791  aminotransferase class V  82.29 
 
 
412 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.644742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2424  aminotransferase class V  80.35 
 
 
406 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2047  alanine--glyoxylate aminotransferase  97.77 
 
 
404 aa  790    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000188057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3219  alanine--glyoxylate aminotransferase  97.77 
 
 
404 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000141381  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0866  alanine--glyoxylate aminotransferase  97.77 
 
 
404 aa  790    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000382013  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3920  aminotransferase, class V  89.55 
 
 
403 aa  730    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84351  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2556  aminotransferase class V  90.05 
 
 
468 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  100 
 
 
404 aa  826    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2700  alanine--glyoxylate aminotransferase  97.52 
 
 
404 aa  790    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265577  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0797  aminotransferase class V  89.8 
 
 
403 aa  731    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0344  aminotransferase, class V  90.3 
 
 
403 aa  736    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0724  aminotransferase class V  90.25 
 
 
403 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3165  aminotransferase, class V  97.77 
 
 
404 aa  790    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00663559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3204  aminotransferase, class V  97.77 
 
 
404 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745679  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0707  aminotransferase, class V  90.05 
 
 
403 aa  730    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0828  aminotransferase, class V  90.3 
 
 
403 aa  736    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0287206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  68.5 
 
 
410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  63.31 
 
 
414 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  38.62 
 
 
404 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  38.46 
 
 
401 aa  263  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  36.26 
 
 
388 aa  233  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  34.31 
 
 
382 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  36.29 
 
 
369 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  35.56 
 
 
378 aa  216  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  34.16 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  36.11 
 
 
377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  36.11 
 
 
377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  33.85 
 
 
380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  35.83 
 
 
377 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  36.11 
 
 
377 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  35.73 
 
 
380 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.79 
 
 
377 aa  211  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  35.28 
 
 
377 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  34.44 
 
 
375 aa  209  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.47 
 
 
377 aa  209  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  34.68 
 
 
380 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.28 
 
 
377 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  37.4 
 
 
396 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.28 
 
 
377 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  37.4 
 
 
396 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  33.33 
 
 
378 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  34.77 
 
 
380 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  32.21 
 
 
381 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  37.12 
 
 
395 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  34.26 
 
 
376 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  33.14 
 
 
375 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  34.62 
 
 
367 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  32.98 
 
 
393 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  32.85 
 
 
375 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  34.42 
 
 
379 aa  203  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  31.83 
 
 
396 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.4 
 
 
380 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  33.96 
 
 
391 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  33.51 
 
 
413 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.9 
 
 
412 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.07 
 
 
366 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.9 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.23 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  33.52 
 
 
373 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  34.06 
 
 
372 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.77 
 
 
394 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.77 
 
 
394 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  33.98 
 
 
393 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  34.07 
 
 
373 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.24 
 
 
394 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.97 
 
 
381 aa  193  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.2 
 
 
394 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.05 
 
 
384 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.2 
 
 
394 aa  189  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  36.11 
 
 
392 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  31.09 
 
 
370 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.92 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  33.13 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  32.26 
 
 
415 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  31.25 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.15 
 
 
381 aa  179  7e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  28.65 
 
 
384 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  34.63 
 
 
362 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  34.33 
 
 
362 aa  176  7e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  33.06 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.15 
 
 
362 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  31.61 
 
 
382 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  31.85 
 
 
413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.65 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  31.85 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  28.85 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  33.03 
 
 
383 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  31.99 
 
 
411 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  30.13 
 
 
382 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.13 
 
 
384 aa  160  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  30.05 
 
 
382 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  30.46 
 
 
412 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  29.19 
 
 
381 aa  159  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  30.18 
 
 
410 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  33.43 
 
 
384 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  30.81 
 
 
451 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  31.89 
 
 
414 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  29.94 
 
 
360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  30.81 
 
 
441 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>