More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2307 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  100 
 
 
360 aa  736    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  49.02 
 
 
383 aa  350  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  47.21 
 
 
386 aa  342  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  46.05 
 
 
383 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  43.85 
 
 
384 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  43.54 
 
 
388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  42.45 
 
 
363 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  45.63 
 
 
385 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  43.5 
 
 
385 aa  298  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  42.5 
 
 
384 aa  296  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  42.7 
 
 
400 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  42.22 
 
 
384 aa  293  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  44.07 
 
 
362 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  43.22 
 
 
362 aa  291  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  43.5 
 
 
362 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  41.11 
 
 
384 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  42.3 
 
 
382 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  40.34 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  40.34 
 
 
384 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  40.44 
 
 
387 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  40.61 
 
 
387 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  41.16 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  39.89 
 
 
382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.78 
 
 
387 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  39.55 
 
 
382 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  39.55 
 
 
382 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  40 
 
 
383 aa  268  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  39.06 
 
 
385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  40.7 
 
 
380 aa  266  5e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  39.66 
 
 
384 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
382 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  39 
 
 
380 aa  265  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  39.48 
 
 
386 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  39.34 
 
 
385 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  39.06 
 
 
382 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  40.17 
 
 
381 aa  256  5e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  38.78 
 
 
382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  36.62 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.39 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  38.5 
 
 
397 aa  252  6e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  36.97 
 
 
360 aa  252  7e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  37.18 
 
 
391 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.27 
 
 
383 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  37.71 
 
 
382 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  37.12 
 
 
382 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  39.49 
 
 
379 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  40 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  37.12 
 
 
382 aa  245  8e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  40.67 
 
 
373 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  37.75 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  37.54 
 
 
382 aa  242  6e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.16 
 
 
382 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  39.11 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  37.46 
 
 
379 aa  239  8e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  36.89 
 
 
379 aa  236  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  37.43 
 
 
387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  37.95 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  37.29 
 
 
387 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  36.39 
 
 
377 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  35.29 
 
 
379 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  36.34 
 
 
389 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  33.7 
 
 
391 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  33.33 
 
 
391 aa  226  6e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  35.56 
 
 
375 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  34.72 
 
 
396 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  33.7 
 
 
396 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  34.77 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  34.92 
 
 
380 aa  222  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  34.48 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  36.39 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  36.6 
 
 
379 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  36.11 
 
 
376 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  34.38 
 
 
398 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  35.62 
 
 
394 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  36.62 
 
 
398 aa  216  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  36.59 
 
 
390 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  33.62 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  35.73 
 
 
391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  35.38 
 
 
391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  34.88 
 
 
395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  35.73 
 
 
391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  33.88 
 
 
401 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  34.73 
 
 
401 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  35.57 
 
 
421 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  33.15 
 
 
422 aa  209  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  32.33 
 
 
406 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  34.64 
 
 
415 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  35.21 
 
 
402 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  33.7 
 
 
400 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  32.13 
 
 
412 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2533  aminotransferase class V  34.83 
 
 
354 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  34.83 
 
 
417 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  33.99 
 
 
417 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  34.29 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  37.05 
 
 
390 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  33.97 
 
 
397 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2387  aminotransferase class V  36.13 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271517  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  34.65 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  35.86 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  33.52 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>