More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002358 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  84.37 
 
 		 372 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  93.57 
 
 		 382 aa  721    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  100 
 
 		 373 aa  768    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  76.15 
 
 		 369 aa  608  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  74.53 
 
 		 380 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  75.4 
 
 		 380 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  75.61 
 
 		 376 aa  596  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  73.73 
 
 		 380 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  75.47 
 
 		 378 aa  588  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  74.6 
 
 		 380 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  74.46 
 
 		 378 aa  586  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  74.66 
 
 		 377 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  74.66 
 
 		 377 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  75.2 
 
 		 377 aa  577  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  71.05 
 
 		 373 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  73.85 
 
 		 377 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  73.32 
 
 		 377 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  71.66 
 
 		 379 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  73.32 
 
 		 377 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  73.05 
 
 		 377 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  73.58 
 
 		 377 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  70.24 
 
 		 373 aa  562  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  68.36 
 
 		 393 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  66.04 
 
 		 391 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  65.94 
 
 		 377 aa  530  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  65.23 
 
 		 375 aa  524  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  64.96 
 
 		 393 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  63.98 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  64.14 
 
 		 344 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  57.46 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  55.68 
 
 		 367 aa  408  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  52.69 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  52.56 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  52.29 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  50.67 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  52.29 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  52.02 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  50.68 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  51.47 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  48.51 
 
 		 394 aa  358  8e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  47.98 
 
 		 394 aa  355  7.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  50.99 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.71 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  50.71 
 
 		 375 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  56 
 
 		 312 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.38 
 
 		 381 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  49.45 
 
 		 370 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  46.03 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.75 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.45 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  44.38 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.84 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.84 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.01 
 
 		 389 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.29 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.62 
 
 		 384 aa  329  4e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  45.62 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  43.09 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  44.17 
 
 		 376 aa  295  9e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  34.74 
 
 		 415 aa  262  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  39.05 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  35.32 
 
 		 406 aa  259  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  36.22 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  35.58 
 
 		 410 aa  256  6e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  34.47 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  36.46 
 
 		 455 aa  249  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  39.84 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  36.84 
 
 		 426 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  35.79 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  36.39 
 
 		 441 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  35.96 
 
 		 414 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  36.39 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  36.58 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  37.17 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  36.13 
 
 		 414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  36.39 
 
 		 414 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  36.03 
 
 		 413 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  37.57 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  33.77 
 
 		 406 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  36.29 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  34.77 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  34.32 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  37.19 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.62 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  34.34 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  34.34 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  33.51 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  36.29 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  34.16 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  36.29 
 
 		 371 aa  212  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.47 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.76 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  35.79 
 
 		 384 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  34.34 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  35.87 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.05 
 
 		 383 aa  206  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.41 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0791  aminotransferase class V  34.49 
 
 		 412 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.644742 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1910  alanine--glyoxylate aminotransferase  34.16 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0577107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>