More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0013 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  100 
 
 		 385 aa  785    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  58.79 
 
 		 384 aa  455  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  61.58 
 
 		 382 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  54.5 
 
 		 383 aa  403  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  48.53 
 
 		 384 aa  363  4e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  48.27 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  49.21 
 
 		 384 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  47.76 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  50.4 
 
 		 385 aa  354  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  48.16 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  47.12 
 
 		 382 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  47.12 
 
 		 382 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  47.21 
 
 		 383 aa  350  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  46.54 
 
 		 382 aa  348  8e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  46.58 
 
 		 380 aa  347  1e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  45.93 
 
 		 380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  48.22 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  45.04 
 
 		 384 aa  335  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  47.55 
 
 		 385 aa  335  7e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  44.59 
 
 		 379 aa  333  4e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  45.33 
 
 		 386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  46.52 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  46.52 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  45.68 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  44.39 
 
 		 381 aa  325  6e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  43.42 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  44.11 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  43.47 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  45.92 
 
 		 386 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  41.84 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  42.28 
 
 		 382 aa  315  7e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  42.01 
 
 		 382 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  41.19 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  43.87 
 
 		 382 aa  308  8e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  42.82 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  45.07 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  42.74 
 
 		 387 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  43.66 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  42.86 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  42.47 
 
 		 387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  42.15 
 
 		 387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  42.86 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  44.83 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  43.42 
 
 		 387 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  43.5 
 
 		 360 aa  298  8e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  42.93 
 
 		 382 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  39.78 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  43.81 
 
 		 395 aa  296  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  40.79 
 
 		 380 aa  295  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  43.56 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  40.9 
 
 		 379 aa  291  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  43.16 
 
 		 401 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  40.37 
 
 		 379 aa  286  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  40.62 
 
 		 394 aa  282  8.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  40.11 
 
 		 379 aa  279  7e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.53 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  39.23 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  39.01 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  39.46 
 
 		 406 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  39.32 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  39.4 
 
 		 406 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  40 
 
 		 406 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  39.95 
 
 		 401 aa  263  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  41.89 
 
 		 402 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  39.13 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  39.06 
 
 		 406 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  38.02 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  40.81 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  40.05 
 
 		 398 aa  258  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  38.4 
 
 		 415 aa  257  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  40 
 
 		 421 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  38.08 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  37.5 
 
 		 391 aa  256  6e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  40.54 
 
 		 391 aa  255  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  39.06 
 
 		 396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  39.36 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  36.87 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  36.87 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  39.23 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  36.9 
 
 		 414 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  38.78 
 
 		 406 aa  252  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  40.83 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  36.74 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  39.5 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  41.02 
 
 		 381 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  37.3 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  35.52 
 
 		 413 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  37.8 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  37.23 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  38.32 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  38.83 
 
 		 422 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  35.36 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  37.57 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  36.81 
 
 		 401 aa  243  6e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  36.72 
 
 		 396 aa  242  7.999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  38.81 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  36.98 
 
 		 396 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  38.34 
 
 		 398 aa  238  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  38.04 
 
 		 395 aa  239  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  37.73 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>