More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0602 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 394 aa  815    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  68.19 
 
 		 406 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  67.68 
 
 		 406 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  67.68 
 
 		 406 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  66.92 
 
 		 406 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  67.09 
 
 		 403 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  68.29 
 
 		 406 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  67.18 
 
 		 406 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  64.5 
 
 		 413 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  65.33 
 
 		 414 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  63.54 
 
 		 401 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  59.48 
 
 		 401 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  60.1 
 
 		 391 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  61.2 
 
 		 398 aa  475  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  59.64 
 
 		 391 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  59.13 
 
 		 391 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  57.25 
 
 		 399 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  57.51 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  60.26 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  57.51 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  57.25 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  55.24 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  55.3 
 
 		 401 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  56.99 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  56.44 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  56.44 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  56.03 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  55.15 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  48.84 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  49.23 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  47.03 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  46.51 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  44.13 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  47.45 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  47.56 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  45.95 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  47.45 
 
 		 402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  46.15 
 
 		 421 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  46.94 
 
 		 402 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  45.17 
 
 		 391 aa  352  5e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  43.34 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  45 
 
 		 400 aa  335  7e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  42.78 
 
 		 398 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  45.43 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  42.82 
 
 		 396 aa  326  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  41.95 
 
 		 396 aa  315  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  42.01 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  41.51 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  42.38 
 
 		 383 aa  295  8e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  40.62 
 
 		 385 aa  282  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  39.28 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  39.28 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  37.79 
 
 		 395 aa  272  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  37.18 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  37.31 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  36.15 
 
 		 395 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  38.79 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  37.77 
 
 		 382 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  39.01 
 
 		 383 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  38.38 
 
 		 385 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  36.67 
 
 		 395 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  38.67 
 
 		 382 aa  259  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  36.99 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  36.99 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  37.43 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  36.14 
 
 		 385 aa  249  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  37.5 
 
 		 386 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.71 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  37.56 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  36.98 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  38.69 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  36.55 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.08 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  37.2 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  37.47 
 
 		 362 aa  242  7.999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  38.74 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  36.73 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  36.36 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  36.69 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  35.73 
 
 		 393 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  34.29 
 
 		 379 aa  240  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  38.63 
 
 		 382 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  34.56 
 
 		 379 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  35.85 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  36.6 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  34.99 
 
 		 385 aa  236  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  37.34 
 
 		 382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.81 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  36.48 
 
 		 383 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  35.35 
 
 		 384 aa  233  6e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  33.51 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  34.64 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1888  aminotransferase, class V  36.34 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0245  Serine-pyruvate aminotransferase/aspartate aminotransferase  36.34 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  33.51 
 
 		 379 aa  226  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  34.54 
 
 		 380 aa  226  8e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  34.1 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  35.92 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  35.62 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2018  Serine--glyoxylate transaminase  35.77 
 
 		 400 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>