More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0781 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  100 
 
 
381 aa  773    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  61.52 
 
 
383 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  57.63 
 
 
380 aa  443  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  50.67 
 
 
375 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  52.39 
 
 
376 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  53.32 
 
 
376 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  49.08 
 
 
377 aa  351  1e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  48.14 
 
 
387 aa  350  3e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  46.61 
 
 
382 aa  317  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  46.09 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  46.09 
 
 
382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  45.31 
 
 
382 aa  305  6e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  42.93 
 
 
387 aa  291  1e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  40.21 
 
 
383 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  45.16 
 
 
382 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  44.47 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  42.67 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  40.82 
 
 
386 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  41.1 
 
 
382 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  41.1 
 
 
382 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  41.08 
 
 
385 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  39.07 
 
 
384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  39.07 
 
 
384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  41.1 
 
 
384 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  38.38 
 
 
385 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  40.31 
 
 
385 aa  257  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  39.66 
 
 
363 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  39.15 
 
 
384 aa  256  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  38.62 
 
 
384 aa  256  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  40.37 
 
 
379 aa  256  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  39.06 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  36.92 
 
 
387 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  39.47 
 
 
380 aa  251  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  41.55 
 
 
386 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  39.11 
 
 
360 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  37.34 
 
 
387 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  36.83 
 
 
387 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  36.91 
 
 
380 aa  249  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  40.05 
 
 
382 aa  249  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  40.44 
 
 
362 aa  248  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.72 
 
 
362 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  39.58 
 
 
379 aa  248  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  40.44 
 
 
362 aa  247  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  37.57 
 
 
382 aa  246  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  37.91 
 
 
387 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  39.01 
 
 
382 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  40.31 
 
 
379 aa  244  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.26 
 
 
400 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  36.19 
 
 
379 aa  242  7e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  38.52 
 
 
379 aa  239  8e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  39.79 
 
 
397 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  37.76 
 
 
381 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  39.22 
 
 
401 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  39.2 
 
 
385 aa  236  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  38.5 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  38.11 
 
 
384 aa  233  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  37.19 
 
 
381 aa  233  5e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  36 
 
 
383 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  34.03 
 
 
380 aa  230  4e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  38.01 
 
 
382 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  37.24 
 
 
404 aa  222  8e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  35.98 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  36.41 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  32.72 
 
 
385 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  32.72 
 
 
385 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.67 
 
 
395 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  35.6 
 
 
399 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  37.63 
 
 
396 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  37.63 
 
 
396 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  37.33 
 
 
362 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  35.37 
 
 
402 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  36.26 
 
 
389 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  35.17 
 
 
415 aa  209  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  35.53 
 
 
395 aa  208  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  36.05 
 
 
393 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  33.77 
 
 
396 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  36.34 
 
 
398 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  34.64 
 
 
391 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  36.46 
 
 
358 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  35.77 
 
 
392 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  35.34 
 
 
417 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  35.14 
 
 
413 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  36.15 
 
 
398 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  37.16 
 
 
379 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  36.26 
 
 
389 aa  203  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  35.62 
 
 
376 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  36.52 
 
 
373 aa  202  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  35.91 
 
 
358 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  36.98 
 
 
357 aa  202  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  37.03 
 
 
391 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  34.03 
 
 
391 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  33.33 
 
 
387 aa  200  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  34.55 
 
 
417 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  33.97 
 
 
384 aa  200  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  35.28 
 
 
373 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  34.88 
 
 
401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  34.21 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  32.3 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  37.24 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  33.71 
 
 
370 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>