More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2413 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  100 
 
 		 415 aa  853    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  89.47 
 
 		 399 aa  743    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  73.54 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  65.89 
 
 		 400 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  62.95 
 
 		 401 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  62.31 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  62.44 
 
 		 391 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  60.97 
 
 		 401 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  61.04 
 
 		 398 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  57.51 
 
 		 401 aa  482  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  62.18 
 
 		 391 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  61.66 
 
 		 391 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  58.73 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  58.84 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  57.04 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  58.85 
 
 		 406 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  57.72 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  58.44 
 
 		 406 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  58.88 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  57.81 
 
 		 403 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  57.25 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  54.62 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  53.98 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  52.55 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  56.82 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  56.31 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  56.19 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  56.06 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  49.23 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  49.74 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  49.74 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  49.47 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  46.82 
 
 		 415 aa  364  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  48.08 
 
 		 397 aa  362  8e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  48.72 
 
 		 402 aa  359  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  44.13 
 
 		 396 aa  355  7.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  45.1 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  44.76 
 
 		 391 aa  353  4e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  46.68 
 
 		 402 aa  352  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  46.68 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  46.68 
 
 		 402 aa  352  8e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  45.57 
 
 		 395 aa  341  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  42.78 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  43.8 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  43.12 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  44.27 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  44.53 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  41.62 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  43.9 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  43.9 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  44.51 
 
 		 383 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  39.59 
 
 		 395 aa  289  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  38.82 
 
 		 395 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  40.36 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  39.33 
 
 		 395 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  41.45 
 
 		 384 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  39.53 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  41.37 
 
 		 363 aa  269  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  40.53 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  38.06 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  38.22 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  39.18 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.72 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  39.63 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  43.18 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  39.68 
 
 		 385 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  37.97 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  38.5 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  38.4 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  37.24 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  42.78 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  42.78 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  38.33 
 
 		 387 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  39.28 
 
 		 382 aa  250  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  35.92 
 
 		 384 aa  249  6e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1983  aminotransferase, class V  38.77 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.441158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  36.46 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  40.76 
 
 		 386 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.96 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  41.67 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  35.19 
 
 		 379 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.54 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  35.94 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  40.11 
 
 		 362 aa  240  4e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  35.42 
 
 		 379 aa  239  5e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  38.26 
 
 		 384 aa  239  8e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  36.91 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  36.03 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  39.54 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  37.57 
 
 		 383 aa  235  9e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  35.68 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  35.11 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  34.97 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  36.69 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.88 
 
 		 382 aa  229  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  35.88 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  34.21 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  35 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  35.34 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1888  aminotransferase, class V  37.15 
 
 		 400 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>