More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0040 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  100 
 
 		 385 aa  777    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  51.94 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  51.67 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  51.39 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  51.11 
 
 		 362 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  50.4 
 
 		 385 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  47 
 
 		 384 aa  352  5e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  46.48 
 
 		 384 aa  350  3e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  47.64 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  48.28 
 
 		 384 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  49.34 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  47.95 
 
 		 386 aa  342  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  45.79 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  45.79 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  50 
 
 		 383 aa  334  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  45 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  44.88 
 
 		 388 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  46.31 
 
 		 387 aa  332  8e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  44.72 
 
 		 384 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  44.72 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  45.01 
 
 		 381 aa  331  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  45.83 
 
 		 387 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  47.48 
 
 		 382 aa  328  7e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  47.55 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  45.36 
 
 		 382 aa  322  7e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  46.3 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  42.67 
 
 		 385 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  44.03 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  44.03 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  45.6 
 
 		 383 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  43.95 
 
 		 383 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  43.68 
 
 		 380 aa  311  9e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  44.09 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  44.56 
 
 		 380 aa  309  4e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  47.75 
 
 		 384 aa  309  5e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  41.69 
 
 		 379 aa  309  5e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  43.68 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  44.24 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  43.96 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  42.11 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  45.63 
 
 		 360 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  41.01 
 
 		 379 aa  296  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  43.92 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  40.96 
 
 		 382 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  40.69 
 
 		 382 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  39.68 
 
 		 379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  40.11 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  41.07 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.16 
 
 		 382 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  39.94 
 
 		 395 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  36.18 
 
 		 391 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.52 
 
 		 380 aa  259  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  36.6 
 
 		 391 aa  258  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.15 
 
 		 383 aa  255  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  38.58 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  38.58 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  40.62 
 
 		 360 aa  252  7e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  38.34 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  33.85 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  35.66 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  36.43 
 
 		 406 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  36.03 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  36.55 
 
 		 417 aa  242  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  38.15 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  36.43 
 
 		 406 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  35.57 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  36.29 
 
 		 406 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  35.31 
 
 		 402 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  36.81 
 
 		 421 aa  239  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  38.25 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  35.05 
 
 		 402 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  36.36 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  39.27 
 
 		 376 aa  237  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  34.99 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  37.23 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  34.7 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  36.75 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  35.23 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  34.84 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  36.87 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  34.54 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  34.27 
 
 		 413 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  35.08 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  37.89 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  34.79 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  37.81 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  35.14 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  34.99 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  35.42 
 
 		 398 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  35.08 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  35.41 
 
 		 391 aa  229  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  35.99 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  35.83 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  35.71 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  34.82 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  37.43 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  35.88 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  34.03 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>