More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2475 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  100 
 
 
377 aa  775    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  69.41 
 
 
376 aa  528  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  69.23 
 
 
375 aa  523  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  66.67 
 
 
376 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  62.5 
 
 
387 aa  483  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  51.59 
 
 
383 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  52.79 
 
 
380 aa  350  2e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  49.08 
 
 
381 aa  330  3e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  44.24 
 
 
382 aa  315  9e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  44.5 
 
 
382 aa  315  9e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  43.98 
 
 
382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  43.19 
 
 
382 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  42.16 
 
 
387 aa  281  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  38.67 
 
 
383 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  39.95 
 
 
382 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  39.95 
 
 
382 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  39.63 
 
 
382 aa  256  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  38.44 
 
 
385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  39.01 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  38.5 
 
 
384 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  37.14 
 
 
387 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  36.76 
 
 
387 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  38.01 
 
 
387 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  38.48 
 
 
384 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  35.54 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  39.89 
 
 
386 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  35.95 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  41.19 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  36.49 
 
 
386 aa  243  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  36.5 
 
 
382 aa  243  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  38.78 
 
 
387 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  39.28 
 
 
397 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  39.19 
 
 
382 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  36.46 
 
 
384 aa  236  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  38.65 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  36.87 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  37.94 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  35.73 
 
 
379 aa  232  7.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  39.63 
 
 
382 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  36.39 
 
 
360 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  36.46 
 
 
388 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  35.66 
 
 
384 aa  230  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  35.28 
 
 
380 aa  225  8e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.99 
 
 
400 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  37.46 
 
 
363 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  34.9 
 
 
381 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  37.43 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  34.91 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  35.46 
 
 
391 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  35.99 
 
 
362 aa  212  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  35.99 
 
 
362 aa  212  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.71 
 
 
362 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  37.09 
 
 
379 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  35.88 
 
 
382 aa  209  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  36.46 
 
 
379 aa  209  8e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  36.54 
 
 
379 aa  207  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  35.62 
 
 
379 aa  206  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  36.24 
 
 
380 aa  204  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  35.97 
 
 
394 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  35 
 
 
391 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  32.28 
 
 
380 aa  201  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  35.17 
 
 
391 aa  199  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  33.52 
 
 
383 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  33.98 
 
 
387 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  33.78 
 
 
389 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  34.91 
 
 
391 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  33.9 
 
 
360 aa  192  9e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  31.82 
 
 
360 aa  192  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  32.88 
 
 
395 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  32.05 
 
 
381 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  34.65 
 
 
391 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  34.44 
 
 
362 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  33.42 
 
 
415 aa  188  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  34.62 
 
 
373 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  35.08 
 
 
402 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  32.55 
 
 
399 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  33.25 
 
 
398 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  33.6 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  34.12 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  34.29 
 
 
366 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  33.86 
 
 
391 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  34.56 
 
 
401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  32.15 
 
 
389 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  32.68 
 
 
385 aa  182  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  31.97 
 
 
374 aa  182  7e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  32.68 
 
 
385 aa  182  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  34.55 
 
 
417 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0190  alanine--glyoxylate transaminase  34.69 
 
 
384 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0814206  normal  0.663999 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  34.2 
 
 
401 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.47 
 
 
394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  33.62 
 
 
404 aa  180  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  33.9 
 
 
358 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  32.98 
 
 
396 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  32.11 
 
 
417 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  32.38 
 
 
401 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  32.72 
 
 
395 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  32.99 
 
 
402 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  32.38 
 
 
396 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  31.94 
 
 
422 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  32.4 
 
 
370 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>