More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4200 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  100 
 
 		 391 aa  791    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  98.98 
 
 		 391 aa  785    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  95.65 
 
 		 391 aa  741    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  79.48 
 
 		 398 aa  625  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  77.52 
 
 		 402 aa  608  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  73.4 
 
 		 401 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  70.98 
 
 		 401 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  71.39 
 
 		 400 aa  541  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  68.05 
 
 		 401 aa  527  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  66.67 
 
 		 406 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  65.89 
 
 		 406 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  65.81 
 
 		 406 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  65.63 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  66.41 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  64.49 
 
 		 395 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  65.1 
 
 		 422 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  63.47 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  62.6 
 
 		 398 aa  505  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  62.18 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  63.82 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  61.58 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  61.13 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  65.97 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  62.21 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  59.64 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  64.16 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  64.94 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  63.64 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  52.94 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  52.43 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  52.08 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  51.79 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  50 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  50 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  50 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  50.39 
 
 		 415 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  51.45 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  49.32 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  48.3 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  45.26 
 
 		 391 aa  345  8e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  47.7 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  45.38 
 
 		 391 aa  343  4e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  44.53 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  45.38 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  43.68 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  43.95 
 
 		 396 aa  323  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  45.21 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  45.65 
 
 		 396 aa  313  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  43.43 
 
 		 395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  42.42 
 
 		 395 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  45.48 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  43.19 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  42.71 
 
 		 395 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  41.84 
 
 		 382 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  41.84 
 
 		 382 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  42.45 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  41.56 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  39.73 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  39.4 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  41.78 
 
 		 382 aa  278  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  41.49 
 
 		 385 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  40.93 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  39.4 
 
 		 384 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  43.99 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  39.9 
 
 		 382 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  41.84 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  40.54 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  40.5 
 
 		 387 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.67 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  39.67 
 
 		 387 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  40.36 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  40.5 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  42.54 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  38.81 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.17 
 
 		 362 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  40.5 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  39.49 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  39.84 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2090  putative serine--glyoxylate aminotransferase  42.93 
 
 		 418 aa  256  6e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.71592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  39.78 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  40.61 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  37.04 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  36.77 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  36.53 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  36.12 
 
 		 381 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  36.31 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  41.4 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2018  Serine--glyoxylate transaminase  40.36 
 
 		 400 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  37.24 
 
 		 380 aa  242  7.999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0729  aminotransferase, class V  40.36 
 
 		 390 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.434547  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  35.99 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  38.64 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  39.57 
 
 		 384 aa  236  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  36.29 
 
 		 379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  35.31 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  35.73 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1983  aminotransferase, class V  37.47 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.441158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.31 
 
 		 382 aa  232  9e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  36.03 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.31 
 
 		 400 aa  229  8e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>