More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0514 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  100 
 
 
380 aa  781    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  66.67 
 
 
383 aa  521  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  57.63 
 
 
381 aa  434  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  54.52 
 
 
376 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  52.63 
 
 
376 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  51.2 
 
 
375 aa  378  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  52.79 
 
 
377 aa  361  9e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  48.92 
 
 
387 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  48.1 
 
 
382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  45.43 
 
 
382 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  44.91 
 
 
382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  45.17 
 
 
382 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  42.93 
 
 
387 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  40.53 
 
 
385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  42.61 
 
 
387 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  40.97 
 
 
387 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  39.47 
 
 
384 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  42.5 
 
 
382 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  40.43 
 
 
387 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  39.95 
 
 
383 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  39.52 
 
 
385 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  40.72 
 
 
363 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  40.63 
 
 
383 aa  270  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  38.85 
 
 
385 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  39.89 
 
 
384 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  39.02 
 
 
384 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  40.58 
 
 
397 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.19 
 
 
387 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  39.9 
 
 
382 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  39.9 
 
 
382 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  39.68 
 
 
381 aa  264  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  40.38 
 
 
382 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  39.39 
 
 
360 aa  263  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  37.11 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  39.48 
 
 
382 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  37.05 
 
 
388 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  38.5 
 
 
386 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  36.32 
 
 
384 aa  256  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  37.6 
 
 
383 aa  256  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  36.32 
 
 
380 aa  255  9e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  38.16 
 
 
384 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  39.23 
 
 
385 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  39.74 
 
 
382 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  38.38 
 
 
382 aa  245  6.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  37.14 
 
 
379 aa  245  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  40.35 
 
 
386 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  36.71 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.36 
 
 
400 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  34.39 
 
 
379 aa  239  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  35.81 
 
 
379 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  38.2 
 
 
362 aa  238  9e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  38.2 
 
 
362 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.92 
 
 
362 aa  236  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  35.7 
 
 
380 aa  232  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  37.11 
 
 
401 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  35.28 
 
 
379 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  37.11 
 
 
391 aa  229  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  35.54 
 
 
379 aa  228  9e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  33.6 
 
 
380 aa  228  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  36.71 
 
 
373 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  33.6 
 
 
382 aa  227  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  36.44 
 
 
381 aa  225  9e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  38.04 
 
 
382 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  34.9 
 
 
385 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  34.9 
 
 
385 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  35.32 
 
 
404 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  39.39 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  39.11 
 
 
391 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  37.2 
 
 
391 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  39.15 
 
 
396 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  39.15 
 
 
395 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  39.15 
 
 
396 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  37.7 
 
 
392 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  35.6 
 
 
390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  35.43 
 
 
401 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  36.74 
 
 
388 aa  216  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  35.68 
 
 
398 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  32.28 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  33.25 
 
 
406 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  33.51 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  35.28 
 
 
387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  34.91 
 
 
402 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  33.33 
 
 
391 aa  211  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  33.15 
 
 
391 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  34.81 
 
 
394 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  33.94 
 
 
396 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  33.59 
 
 
391 aa  210  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  35.43 
 
 
375 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  32.58 
 
 
414 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  36.41 
 
 
373 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  35.57 
 
 
412 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  35.14 
 
 
375 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  35.82 
 
 
395 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  36 
 
 
375 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  33.33 
 
 
381 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  34.82 
 
 
417 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  34.59 
 
 
355 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  35.42 
 
 
421 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  33.98 
 
 
406 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  34.29 
 
 
417 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>