More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1504 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  100 
 
 		 379 aa  773    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  54.37 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  45.65 
 
 		 379 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  44.06 
 
 		 379 aa  355  8.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  44.06 
 
 		 379 aa  354  2e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  43.8 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  44.44 
 
 		 400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  43.31 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  41.95 
 
 		 380 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  42.78 
 
 		 384 aa  338  8e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  43.68 
 
 		 384 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  42.78 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  44.59 
 
 		 385 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  45.83 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  45.95 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  41.69 
 
 		 385 aa  309  5e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  41.8 
 
 		 383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  43.45 
 
 		 382 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  41.8 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  41.8 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  40.83 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  40.71 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  37.83 
 
 		 380 aa  297  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  41.18 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  40.93 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  43.49 
 
 		 387 aa  292  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  43.37 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  43.09 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  40.27 
 
 		 384 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  41.56 
 
 		 395 aa  288  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  40.7 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  42.63 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  39.61 
 
 		 385 aa  285  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  38.67 
 
 		 391 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  39.58 
 
 		 382 aa  284  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  39.9 
 
 		 384 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.82 
 
 		 362 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  39.9 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  40.86 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  40 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  40.27 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  40.56 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  39.84 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  37.93 
 
 		 384 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  38.99 
 
 		 382 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  38.03 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.77 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  37.5 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  39.06 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  39.01 
 
 		 382 aa  265  7e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  35.08 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  40.67 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  38.7 
 
 		 383 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  34.9 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  38.14 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  35.81 
 
 		 388 aa  255  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  35.93 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  37.5 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.44 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  39.49 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  34.92 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.81 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  33.78 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  34.39 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  33.78 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  34.56 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  33.85 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.39 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  35.73 
 
 		 377 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  36.73 
 
 		 398 aa  232  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  34.13 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  33.25 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  33.16 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  39.28 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  33.16 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  36.19 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  34.19 
 
 		 402 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0073  aminotransferase, class V  39.73 
 
 		 370 aa  229  8e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2387  aminotransferase class V  37.02 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  34.04 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  32.98 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  37.15 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  36.32 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  36.69 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  36.29 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  34.05 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  34.41 
 
 		 422 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  35.37 
 
 		 375 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  37.6 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  35.69 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  32.63 
 
 		 396 aa  223  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  34.23 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  32.9 
 
 		 413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  34.68 
 
 		 401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  34.6 
 
 		 401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  32.98 
 
 		 406 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  35.51 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  34.76 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>