More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1361 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  100 
 
 		 384 aa  792    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  99.74 
 
 		 384 aa  790    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  67.45 
 
 		 385 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  70.68 
 
 		 382 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  73.08 
 
 		 382 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  70.16 
 
 		 397 aa  565  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  68.58 
 
 		 387 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  66.76 
 
 		 387 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  66.94 
 
 		 387 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  65.12 
 
 		 387 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  61.78 
 
 		 382 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  61.78 
 
 		 382 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  63.07 
 
 		 382 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  58.53 
 
 		 384 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  59.95 
 
 		 385 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  62.09 
 
 		 386 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  56.69 
 
 		 382 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  44.69 
 
 		 383 aa  339  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  44.72 
 
 		 385 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  43.23 
 
 		 381 aa  325  9e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  43.33 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  43.33 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  44.11 
 
 		 385 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  43.06 
 
 		 362 aa  322  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  43.7 
 
 		 383 aa  315  7e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  41.55 
 
 		 363 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  39.01 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  39.06 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  40.58 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  40.58 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  45.09 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  42.6 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  42.16 
 
 		 386 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  38.96 
 
 		 383 aa  299  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  41.29 
 
 		 379 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  40.64 
 
 		 382 aa  294  1e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  41.18 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.63 
 
 		 382 aa  294  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  41.18 
 
 		 382 aa  292  7e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  39.53 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.66 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  39.84 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  40.37 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  40.11 
 
 		 379 aa  288  9e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  39.9 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  40.21 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  37.93 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  37.93 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  39.22 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  40.34 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  38.06 
 
 		 415 aa  268  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  38.95 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  39.4 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  39.4 
 
 		 391 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  34.79 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  36.22 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  39.19 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  36.96 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.89 
 
 		 380 aa  260  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  38.06 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  35.25 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.07 
 
 		 383 aa  255  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  34.34 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  36.99 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  36.7 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  38.7 
 
 		 401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  38.23 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  39.07 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  36.99 
 
 		 406 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  37.43 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  35.87 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  36.1 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  36.44 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  38.65 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  34.83 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  36.54 
 
 		 422 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  34.58 
 
 		 398 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  34.64 
 
 		 391 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  35.19 
 
 		 396 aa  245  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  37.24 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  35.54 
 
 		 377 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  35.48 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  36.16 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  33.78 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  34.73 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  34.07 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  36.15 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  33.79 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  35.03 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  37.27 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  35.12 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  33.24 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  35.07 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  35.62 
 
 		 406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  36.18 
 
 		 376 aa  235  8e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  32.69 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  35.56 
 
 		 381 aa  234  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  33.94 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  33.95 
 
 		 415 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>