More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1429 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  97.4 
 
 		 384 aa  766    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  100 
 
 		 384 aa  783    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  73.74 
 
 		 380 aa  590  1e-168  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  68.07 
 
 		 380 aa  537  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  63.68 
 
 		 382 aa  519  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  48.42 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  48.27 
 
 		 385 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  44.8 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  48.14 
 
 		 384 aa  359  5e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  46.42 
 
 		 383 aa  353  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  43.73 
 
 		 379 aa  353  2e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  46.48 
 
 		 385 aa  350  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  43.47 
 
 		 379 aa  348  7e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  45.68 
 
 		 381 aa  341  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  43.09 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  47.2 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  44.24 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  42.78 
 
 		 379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  43.85 
 
 		 363 aa  335  9e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  42.4 
 
 		 379 aa  333  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  45.91 
 
 		 385 aa  332  8e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  45.38 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  45.38 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  46.44 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  45.88 
 
 		 386 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  44.71 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  41.36 
 
 		 385 aa  315  8e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  43.79 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  43.79 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  43.5 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  40.37 
 
 		 382 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  42.15 
 
 		 387 aa  308  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  40.58 
 
 		 384 aa  308  8e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  40.58 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.43 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  43.09 
 
 		 382 aa  305  7e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  40.11 
 
 		 382 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  42.06 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  42.37 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  41.87 
 
 		 387 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  40.38 
 
 		 382 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  39.9 
 
 		 388 aa  298  8e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  41.69 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  42.22 
 
 		 360 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  41.16 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  40.22 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  42.11 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  42.66 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  38.42 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  39.79 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  38.02 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  39.47 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.84 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  38.34 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  40.44 
 
 		 391 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  40.51 
 
 		 395 aa  278  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  39.2 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  37.3 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  38.78 
 
 		 389 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  36.77 
 
 		 391 aa  269  5e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  40.17 
 
 		 394 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  39.58 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  35.98 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  36.86 
 
 		 417 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  37.01 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  37.76 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  36.77 
 
 		 396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  36.53 
 
 		 396 aa  259  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  37.17 
 
 		 415 aa  256  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  35.79 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  36.27 
 
 		 396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  36.2 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  36.46 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  36.2 
 
 		 402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  37.27 
 
 		 399 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  39.33 
 
 		 374 aa  253  6e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  35.94 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  37.1 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  37.77 
 
 		 398 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  35.6 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  35.71 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  41.55 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  36.46 
 
 		 415 aa  247  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.32 
 
 		 380 aa  246  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  35.68 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  38.79 
 
 		 402 aa  244  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  35.6 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  34.11 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  36.7 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  37.3 
 
 		 391 aa  242  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  35.57 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  35.57 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  36.73 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  35.04 
 
 		 406 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  35.29 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  38.62 
 
 		 381 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  35.75 
 
 		 398 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  36.77 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  34.83 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  36.44 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>