More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1188 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  100 
 
 		 383 aa  781    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  55.67 
 
 		 386 aa  441  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  47.76 
 
 		 385 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  46.68 
 
 		 384 aa  356  5e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  47 
 
 		 384 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  46.42 
 
 		 384 aa  353  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  49.02 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  44.68 
 
 		 385 aa  348  7e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  46.86 
 
 		 383 aa  347  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  44.39 
 
 		 400 aa  346  5e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  44.79 
 
 		 382 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  44.79 
 
 		 382 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  46.96 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  46.96 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  47.24 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  46.48 
 
 		 380 aa  341  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  44.69 
 
 		 384 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  44.69 
 
 		 384 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  46.26 
 
 		 387 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  46.54 
 
 		 387 aa  338  8e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  46.22 
 
 		 387 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  44.99 
 
 		 386 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  47.06 
 
 		 382 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  43.72 
 
 		 388 aa  332  8e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  44.27 
 
 		 385 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  43.49 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  45.13 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  44.14 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  45.81 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  44.38 
 
 		 363 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  45.55 
 
 		 382 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  45.55 
 
 		 382 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  44.79 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  42.71 
 
 		 382 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  44.41 
 
 		 381 aa  322  7e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  45.83 
 
 		 379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  43.34 
 
 		 380 aa  319  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  44.01 
 
 		 382 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  44.63 
 
 		 382 aa  315  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  43.16 
 
 		 384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  45.6 
 
 		 385 aa  312  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  44.74 
 
 		 383 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  44.69 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  40.84 
 
 		 379 aa  305  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  44.94 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  41.51 
 
 		 380 aa  301  9e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  40.05 
 
 		 379 aa  299  6e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  40.05 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  42.04 
 
 		 383 aa  292  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  41.25 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  42.3 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  40.84 
 
 		 421 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  39.43 
 
 		 375 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  42.45 
 
 		 391 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  41.9 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  42.22 
 
 		 394 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  41.93 
 
 		 391 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  40.21 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  40.21 
 
 		 398 aa  266  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  38.67 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  40.21 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  39.12 
 
 		 415 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  39.01 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.95 
 
 		 380 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  37.4 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  39.04 
 
 		 406 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  39.63 
 
 		 415 aa  260  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  39.53 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  40.21 
 
 		 402 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  39.59 
 
 		 402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  38.85 
 
 		 417 aa  259  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  37.9 
 
 		 395 aa  259  7e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  39.59 
 
 		 402 aa  259  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  39.14 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  38.85 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  38.5 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 376 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  39.79 
 
 		 401 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  38.44 
 
 		 376 aa  256  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  39.07 
 
 		 402 aa  255  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  37.98 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  37.47 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  38.02 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  36.62 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  38.79 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  38.89 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  36.32 
 
 		 381 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  35.79 
 
 		 413 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  36.46 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  38.07 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  36.32 
 
 		 414 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  36.6 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  36.03 
 
 		 403 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  36.34 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  37.82 
 
 		 422 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  39.43 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  37 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  37.18 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  36.73 
 
 		 406 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>