More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0044 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  85.83 
 
 
382 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  90.29 
 
 
397 aa  689    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  100 
 
 
382 aa  781    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  70.68 
 
 
384 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  70.68 
 
 
384 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  69.29 
 
 
385 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  66.76 
 
 
387 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  66.75 
 
 
382 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  66.75 
 
 
382 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  66.94 
 
 
387 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  65.93 
 
 
387 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  68.46 
 
 
382 aa  528  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  64.29 
 
 
387 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  61.42 
 
 
384 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  63.35 
 
 
385 aa  507  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  64.84 
 
 
386 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  59.69 
 
 
382 aa  488  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  46.81 
 
 
381 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  45.55 
 
 
388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  44.79 
 
 
383 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  47.2 
 
 
383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  43.5 
 
 
385 aa  323  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  44.48 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  44.6 
 
 
362 aa  319  5e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  45.43 
 
 
363 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  44.48 
 
 
362 aa  318  9e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  44.33 
 
 
384 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  43.54 
 
 
385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  42.59 
 
 
384 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  43.19 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  42.33 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  41.73 
 
 
380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  45.09 
 
 
382 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  41.44 
 
 
386 aa  299  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  41.88 
 
 
380 aa  298  9e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  42.78 
 
 
400 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  40.47 
 
 
382 aa  291  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  40.21 
 
 
382 aa  289  6e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  40.47 
 
 
382 aa  289  6e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.21 
 
 
382 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  40.53 
 
 
379 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  38.93 
 
 
379 aa  277  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  41.47 
 
 
379 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  40.68 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  40.26 
 
 
379 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  40.42 
 
 
387 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  40.26 
 
 
379 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  38.74 
 
 
395 aa  270  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  39.84 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.58 
 
 
380 aa  269  8e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  41.47 
 
 
399 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  40.26 
 
 
398 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  38.78 
 
 
360 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  41.67 
 
 
415 aa  263  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  40.63 
 
 
391 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  40.9 
 
 
391 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  40.63 
 
 
391 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  35.77 
 
 
385 aa  259  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  35.77 
 
 
385 aa  259  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  36.74 
 
 
384 aa  259  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  37.3 
 
 
382 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.5 
 
 
383 aa  257  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  41.6 
 
 
376 aa  256  6e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  40.63 
 
 
402 aa  255  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  38.22 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  39.95 
 
 
375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  40.63 
 
 
401 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  38.48 
 
 
398 aa  252  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  37.53 
 
 
396 aa  252  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  38.56 
 
 
406 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  38.54 
 
 
401 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  38.66 
 
 
377 aa  249  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  37.66 
 
 
414 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  39.5 
 
 
401 aa  249  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  38.52 
 
 
406 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  38.8 
 
 
406 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  37.13 
 
 
391 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  37.66 
 
 
413 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  38.99 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  38.52 
 
 
406 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  37.1 
 
 
422 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  38.36 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  39.78 
 
 
395 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  38.13 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  37.5 
 
 
398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  40.64 
 
 
400 aa  242  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  37.12 
 
 
387 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  35.94 
 
 
389 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  37.37 
 
 
415 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  37.98 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  37.5 
 
 
403 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  35.2 
 
 
391 aa  235  8e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  36.53 
 
 
396 aa  235  9e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  37.43 
 
 
395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  36.51 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  38.24 
 
 
387 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  36.55 
 
 
396 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  35.08 
 
 
396 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  34.4 
 
 
391 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  37.63 
 
 
402 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.569732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>