More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4850 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 390 aa  799    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  46.17 
 
 		 381 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.73 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44075  predicted protein  34.12 
 
 		 379 aa  229  9e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  35.66 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  33.16 
 
 		 382 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  32.89 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  35.64 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  34.78 
 
 		 385 aa  216  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.2 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  36.59 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  34.2 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  35.2 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  32.55 
 
 		 384 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  33.93 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  31.79 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  32.63 
 
 		 385 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.6 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 383 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  34.05 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  32.53 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 363 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01342  hypothetical alanine--glyoxylate aminotransferase (Eurofung)  32.77 
 
 		 386 aa  202  6e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000773374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  33.78 
 
 		 386 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  33.79 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  32.39 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  32.99 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  34.06 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  33.16 
 
 		 384 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.43 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  33.6 
 
 		 382 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  33.87 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  34.22 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  30.03 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  30.03 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.97 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  32.4 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  30.87 
 
 		 404 aa  193  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  30.83 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  31.58 
 
 		 394 aa  193  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.6 
 
 		 377 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  32.35 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  33.62 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  31.82 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  33.24 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  32.29 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  32.62 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  32.89 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  32.76 
 
 		 367 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  29.23 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  32.81 
 
 		 401 aa  189  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  32.12 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  33.6 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  33.95 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  32.7 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  32.67 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05470  alanine-glyoxylate transaminase, putative  34.08 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  33.16 
 
 		 377 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  33.43 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  31.03 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  31.03 
 
 		 402 aa  186  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  32.53 
 
 		 377 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  32.61 
 
 		 398 aa  186  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  31.03 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  32.26 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  31.64 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0835  alanine--glyoxylate transaminase  34.13 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.6 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.91 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  32.26 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  31.08 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  32.6 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  31.1 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  33.89 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  30.9 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  32.21 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.95 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  31.2 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  33.51 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  31.3 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.91 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  27.79 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  28.34 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  29.37 
 
 		 413 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  32.89 
 
 		 380 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.3 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  32.7 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  30.47 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  30.65 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  32.89 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  28.87 
 
 		 406 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  31.83 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  32.02 
 
 		 373 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  30.83 
 
 		 373 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0828  aminotransferase, class V  30.51 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  29.19 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>