More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0163 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 396 aa  808    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  45.12 
 
 		 401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  46.32 
 
 		 381 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.52 
 
 		 395 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  43.46 
 
 		 404 aa  345  8.999999999999999e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  45.41 
 
 		 381 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  45.33 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  43.88 
 
 		 413 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  42.28 
 
 		 393 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  47.55 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  47.55 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  46.88 
 
 		 375 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  46.88 
 
 		 375 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.05 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  47.27 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  43.21 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  42.51 
 
 		 393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  43.32 
 
 		 391 aa  329  6e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  43.29 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  43.29 
 
 		 377 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  43.01 
 
 		 377 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  43.29 
 
 		 377 aa  322  8e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.68 
 
 		 394 aa  322  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  43.01 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  44.08 
 
 		 412 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  43.01 
 
 		 378 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.8 
 
 		 412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  43.09 
 
 		 382 aa  319  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.01 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  43.09 
 
 		 373 aa  317  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.62 
 
 		 377 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.99 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  42.74 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  43.17 
 
 		 377 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  42.51 
 
 		 373 aa  312  5.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  42.58 
 
 		 394 aa  312  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.47 
 
 		 377 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.74 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.86 
 
 		 384 aa  310  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  41.71 
 
 		 378 aa  309  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  42.59 
 
 		 394 aa  309  5e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  42.19 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.23 
 
 		 380 aa  306  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.35 
 
 		 394 aa  305  7e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  41.76 
 
 		 369 aa  305  7e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  40.75 
 
 		 379 aa  305  7e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  39.63 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  41.46 
 
 		 380 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  42.01 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  42.39 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  41.19 
 
 		 380 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  40.21 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  42.43 
 
 		 372 aa  299  7e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  38.21 
 
 		 412 aa  293  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  38.27 
 
 		 373 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  41.16 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  37.38 
 
 		 455 aa  279  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  35.15 
 
 		 409 aa  278  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  35.16 
 
 		 413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  34.33 
 
 		 406 aa  272  9e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  34.99 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  34.74 
 
 		 441 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  34 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  39.78 
 
 		 389 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  33.83 
 
 		 414 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  34 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  33.92 
 
 		 410 aa  256  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  37.47 
 
 		 370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  33.99 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  34.08 
 
 		 414 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  34.24 
 
 		 414 aa  252  9.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  36.52 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.06 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  37.2 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  33.17 
 
 		 415 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  37.27 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  37.8 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  37.98 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  35.4 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  42.47 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  37.89 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  32.92 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  34.82 
 
 		 376 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  32.72 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  32.89 
 
 		 384 aa  216  7e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.51 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.29 
 
 		 383 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  35.91 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  33.86 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  32.14 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  33.24 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  34.52 
 
 		 387 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.53 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  31.83 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  34.81 
 
 		 379 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  33.97 
 
 		 387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0724  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0707  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3920  aminotransferase, class V  33.06 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84351  normal  0.952882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>