More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0366 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  97.35 
 
 		 378 aa  754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  93.63 
 
 		 377 aa  731    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  93.63 
 
 		 377 aa  730    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  87.6 
 
 		 380 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  86.84 
 
 		 380 aa  679    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  93.63 
 
 		 377 aa  730    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  94.96 
 
 		 377 aa  738    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  85.41 
 
 		 378 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  84.96 
 
 		 379 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  93.9 
 
 		 377 aa  731    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  86.84 
 
 		 380 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  100 
 
 		 377 aa  774    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  97.35 
 
 		 377 aa  752    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  84.92 
 
 		 380 aa  657    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  98.94 
 
 		 377 aa  763    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  82.76 
 
 		 376 aa  646    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  74.66 
 
 		 373 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  74.66 
 
 		 382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  71.97 
 
 		 373 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  72.43 
 
 		 369 aa  566  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  71.62 
 
 		 373 aa  552  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  72.9 
 
 		 372 aa  551  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  70.38 
 
 		 393 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  69.89 
 
 		 375 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  68.92 
 
 		 393 aa  538  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  67.65 
 
 		 391 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  65.33 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  65.58 
 
 		 377 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  66.47 
 
 		 344 aa  475  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  56.4 
 
 		 371 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  55.92 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  51.47 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  52.8 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  52.53 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  52.8 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  51.73 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  49.73 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  51.1 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  51.98 
 
 		 375 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  51.41 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.08 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  51.23 
 
 		 392 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.33 
 
 		 394 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  55.18 
 
 		 312 aa  334  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  47.86 
 
 		 394 aa  332  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  46.79 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  46.79 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.32 
 
 		 384 aa  329  4e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  44.47 
 
 		 394 aa  328  7e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.26 
 
 		 394 aa  324  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.67 
 
 		 394 aa  322  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  46.26 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.67 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  47.37 
 
 		 370 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.44 
 
 		 380 aa  315  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  42.62 
 
 		 396 aa  315  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.05 
 
 		 366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.72 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  41.83 
 
 		 376 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  35.23 
 
 		 415 aa  260  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  38.86 
 
 		 412 aa  256  5e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  35.23 
 
 		 410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  35.23 
 
 		 411 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  35.13 
 
 		 409 aa  249  6e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  36.53 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  34.46 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  38.96 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  36.01 
 
 		 426 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  34.78 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  35.71 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  35.92 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  35.92 
 
 		 414 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  34.86 
 
 		 413 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  35.49 
 
 		 455 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  34.27 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  35.14 
 
 		 414 aa  229  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  35.31 
 
 		 418 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  36.39 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  36.11 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  36.11 
 
 		 382 aa  222  8e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  34.06 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  34.52 
 
 		 385 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.46 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  34.08 
 
 		 410 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  35.81 
 
 		 371 aa  212  9e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  33.68 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  33.79 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  34.22 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  37.02 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  35.69 
 
 		 386 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  35.26 
 
 		 379 aa  209  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  35.28 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  34.33 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.33 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  34.88 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  34.34 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  34.88 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  34.07 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2700  alanine--glyoxylate aminotransferase  35.83 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>