More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01996 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  100 
 
 		 344 aa  712    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  72.59 
 
 		 375 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  66.18 
 
 		 393 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  66.47 
 
 		 376 aa  484  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  67.35 
 
 		 378 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  63.95 
 
 		 373 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  66.47 
 
 		 377 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  66.18 
 
 		 377 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  63.85 
 
 		 369 aa  478  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  65.89 
 
 		 377 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  65.71 
 
 		 380 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  63.37 
 
 		 377 aa  475  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  65.01 
 
 		 382 aa  474  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  65.89 
 
 		 377 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  66.47 
 
 		 377 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  66.18 
 
 		 377 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  66.57 
 
 		 378 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  63.56 
 
 		 373 aa  473  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  62.39 
 
 		 391 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  63.27 
 
 		 393 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  62.1 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  65.51 
 
 		 379 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  65.7 
 
 		 377 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  64.55 
 
 		 380 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  64.14 
 
 		 373 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  65.61 
 
 		 380 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  67.06 
 
 		 377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  64.53 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  61.34 
 
 		 372 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  52.33 
 
 		 371 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  50.87 
 
 		 367 aa  361  9e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  50 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  49.86 
 
 		 375 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  49.28 
 
 		 375 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.98 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  48.98 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  48.98 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  48.55 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  47.54 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  48.55 
 
 		 381 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.24 
 
 		 381 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  50.15 
 
 		 412 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  49.85 
 
 		 412 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  48.07 
 
 		 394 aa  327  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.1 
 
 		 384 aa  327  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  52.68 
 
 		 312 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  50.73 
 
 		 392 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.48 
 
 		 394 aa  322  7e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  48.34 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  48.98 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  48.5 
 
 		 394 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.24 
 
 		 389 aa  308  6.999999999999999e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45 
 
 		 394 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.59 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45 
 
 		 394 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  41.16 
 
 		 396 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  41.16 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  40.52 
 
 		 376 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  36.21 
 
 		 412 aa  232  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  35.31 
 
 		 415 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  34.62 
 
 		 455 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  33.8 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  35.73 
 
 		 409 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  35.73 
 
 		 436 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  34.44 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.67 
 
 		 382 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  34.82 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  35.1 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  33.9 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  36.11 
 
 		 414 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  35.1 
 
 		 414 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  34.44 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  36.01 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  38.19 
 
 		 384 aa  208  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  35.28 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  34.17 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  33.52 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  34.44 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  33.61 
 
 		 413 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  32.94 
 
 		 410 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  34.88 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.88 
 
 		 382 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  36.73 
 
 		 387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  34.3 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  34.78 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.5 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  35.21 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  34.95 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  33.13 
 
 		 404 aa  185  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  33.23 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.57 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  32.95 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  32.56 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  33.94 
 
 		 373 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  33.94 
 
 		 383 aa  179  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.72 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  33.43 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.79 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.87 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>