More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0881 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  87.06 
 
 
394 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  95.43 
 
 
394 aa  778    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  100 
 
 
394 aa  810    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  97.21 
 
 
394 aa  792    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  67.8 
 
 
412 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  67.28 
 
 
412 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  69.23 
 
 
366 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  66.14 
 
 
394 aa  549  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  65.37 
 
 
394 aa  547  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  63.21 
 
 
394 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  64.89 
 
 
384 aa  500  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  58.73 
 
 
381 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  59.24 
 
 
381 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  60.68 
 
 
375 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  60.97 
 
 
375 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  44.82 
 
 
388 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  45.83 
 
 
404 aa  360  3e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  46.86 
 
 
401 aa  358  9.999999999999999e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  47.19 
 
 
367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  43.84 
 
 
373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  45.14 
 
 
395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  43.58 
 
 
413 aa  335  7e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  44.86 
 
 
396 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  44.29 
 
 
391 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  44.86 
 
 
396 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  45.38 
 
 
380 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  44.38 
 
 
382 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  44.57 
 
 
380 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  43.97 
 
 
375 aa  333  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  45.88 
 
 
376 aa  333  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  45.01 
 
 
377 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  45.01 
 
 
377 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  45.23 
 
 
380 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  44.74 
 
 
377 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  43.09 
 
 
393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  44.47 
 
 
377 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  46.93 
 
 
369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  44.41 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  45.18 
 
 
379 aa  325  6e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  44.11 
 
 
378 aa  325  6e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  43.87 
 
 
373 aa  323  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  43.94 
 
 
378 aa  324  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  44.78 
 
 
372 aa  324  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  42.47 
 
 
373 aa  323  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  43.94 
 
 
377 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  43.94 
 
 
377 aa  323  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  45.18 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  43.67 
 
 
377 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  43.94 
 
 
377 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  43.53 
 
 
393 aa  319  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  41.37 
 
 
377 aa  318  9e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  43.01 
 
 
396 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  41.96 
 
 
380 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  43.59 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  42.3 
 
 
371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  43.9 
 
 
389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  45 
 
 
344 aa  302  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  35.31 
 
 
415 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  36.62 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  36.6 
 
 
413 aa  272  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  35.04 
 
 
411 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  36.72 
 
 
451 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  36.72 
 
 
441 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  35.16 
 
 
414 aa  259  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  34.47 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  36.97 
 
 
414 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  36.07 
 
 
426 aa  259  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  33 
 
 
436 aa  258  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  35.42 
 
 
414 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  32.9 
 
 
455 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  34.83 
 
 
406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  33.51 
 
 
418 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  35.16 
 
 
414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  34.29 
 
 
409 aa  249  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  33.86 
 
 
406 aa  249  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  36.18 
 
 
376 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  38.08 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  39.73 
 
 
312 aa  229  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  34.6 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.07 
 
 
387 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.65 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  35.67 
 
 
387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.38 
 
 
387 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  35.96 
 
 
385 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  33.82 
 
 
371 aa  206  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  31.76 
 
 
382 aa  206  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  33.06 
 
 
379 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  34.2 
 
 
386 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  31.47 
 
 
382 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  34.48 
 
 
382 aa  202  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  31.13 
 
 
410 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  33.69 
 
 
385 aa  199  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  32.41 
 
 
384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  30.08 
 
 
384 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  32.17 
 
 
385 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  32.17 
 
 
387 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  35.16 
 
 
386 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  32.77 
 
 
404 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  32.38 
 
 
414 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  28.97 
 
 
384 aa  192  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>