More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0127 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  100 
 
 
380 aa  793    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  46.67 
 
 
381 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  47.67 
 
 
401 aa  350  3e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.56 
 
 
395 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  46.63 
 
 
404 aa  348  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  49.05 
 
 
396 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  49.05 
 
 
396 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.6 
 
 
394 aa  345  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.78 
 
 
384 aa  345  8e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  47.69 
 
 
375 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  47.26 
 
 
375 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  46.09 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.44 
 
 
381 aa  339  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  44.5 
 
 
394 aa  334  1e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  46.15 
 
 
388 aa  333  2e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  43.16 
 
 
394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  49.18 
 
 
392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.8 
 
 
377 aa  326  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  45.11 
 
 
391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  45.68 
 
 
393 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  44.99 
 
 
379 aa  322  7e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  45.36 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  45.62 
 
 
373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  44.72 
 
 
378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.56 
 
 
366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  44.27 
 
 
380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  44.54 
 
 
378 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  42.23 
 
 
394 aa  319  5e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  44.32 
 
 
380 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  42.03 
 
 
412 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  42.47 
 
 
373 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  42.03 
 
 
412 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.99 
 
 
377 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  41.96 
 
 
394 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  44.17 
 
 
377 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  44.35 
 
 
382 aa  315  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  44.17 
 
 
377 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.44 
 
 
377 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.44 
 
 
377 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  43.9 
 
 
377 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  44.05 
 
 
377 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  41.42 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  43.97 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  44.17 
 
 
377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  43.32 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  41.71 
 
 
394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  43.87 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  42.78 
 
 
369 aa  312  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  43.94 
 
 
413 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  42.9 
 
 
373 aa  309  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  44.89 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  42.23 
 
 
396 aa  306  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  43.05 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  42.7 
 
 
371 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  41.16 
 
 
344 aa  276  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  39.84 
 
 
370 aa  259  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  40.11 
 
 
389 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  36.41 
 
 
455 aa  243  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  36.11 
 
 
415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  35.79 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  38.57 
 
 
384 aa  229  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  37.43 
 
 
376 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  34.65 
 
 
441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.81 
 
 
382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  34.64 
 
 
414 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  35.79 
 
 
418 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  34.55 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  33.94 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  35.83 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  33.51 
 
 
410 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  32.3 
 
 
413 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  33.42 
 
 
414 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  35.7 
 
 
426 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  32.9 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  36.15 
 
 
387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  34.39 
 
 
384 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.9 
 
 
382 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  34.15 
 
 
379 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  33.42 
 
 
406 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  34.9 
 
 
382 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  39.39 
 
 
312 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  32.55 
 
 
409 aa  210  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  34.55 
 
 
406 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  34.37 
 
 
381 aa  206  8e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  34.31 
 
 
382 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  35.65 
 
 
436 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  34.78 
 
 
380 aa  204  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.33 
 
 
384 aa  203  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  35.4 
 
 
404 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  34.07 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.72 
 
 
383 aa  199  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  33.04 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0344  aminotransferase, class V  36.58 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  34.12 
 
 
414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0828  aminotransferase, class V  36.58 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0287206  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3920  aminotransferase, class V  36.28 
 
 
403 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84351  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0797  aminotransferase class V  36.28 
 
 
403 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0707  aminotransferase, class V  34.82 
 
 
403 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2556  aminotransferase class V  36.28 
 
 
468 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0724  aminotransferase class V  34.82 
 
 
403 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>