More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0977 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  100 
 
 
379 aa  756    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  84.66 
 
 
371 aa  615  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  51.36 
 
 
384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  41.23 
 
 
367 aa  245  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  40.93 
 
 
396 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  40.93 
 
 
396 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  40.66 
 
 
395 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  40.77 
 
 
392 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  38.55 
 
 
370 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  36.16 
 
 
413 aa  230  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  38.83 
 
 
381 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  36.36 
 
 
404 aa  226  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  36.46 
 
 
373 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  36.99 
 
 
393 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  37.19 
 
 
373 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  35.34 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  37.22 
 
 
369 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  37.47 
 
 
382 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  35.44 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.91 
 
 
377 aa  216  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.09 
 
 
377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.13 
 
 
412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.13 
 
 
412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.11 
 
 
384 aa  213  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.36 
 
 
394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  37.54 
 
 
375 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  37.14 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  36.09 
 
 
377 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  36.34 
 
 
380 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  36.09 
 
 
377 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  34.15 
 
 
380 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  36.09 
 
 
377 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  36.09 
 
 
377 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  36.09 
 
 
377 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  36.96 
 
 
375 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  34.52 
 
 
391 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.26 
 
 
377 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  34.71 
 
 
378 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.33 
 
 
394 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  35.52 
 
 
393 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  36.46 
 
 
376 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  35.16 
 
 
366 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.21 
 
 
381 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  37.61 
 
 
394 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.06 
 
 
394 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.51 
 
 
394 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.06 
 
 
394 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  34.81 
 
 
396 aa  202  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  37.02 
 
 
372 aa  203  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  32.51 
 
 
373 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  34.25 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  35.16 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.54 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  32.39 
 
 
390 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  34.25 
 
 
375 aa  199  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  34.15 
 
 
380 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  33.71 
 
 
382 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  34.71 
 
 
378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  36.11 
 
 
376 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  33.62 
 
 
387 aa  193  5e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  34.25 
 
 
380 aa  192  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  34.78 
 
 
344 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  34.63 
 
 
371 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.85 
 
 
383 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  34.02 
 
 
381 aa  189  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  37.16 
 
 
381 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.59 
 
 
382 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  32.14 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  31.87 
 
 
382 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  35.02 
 
 
312 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.24 
 
 
380 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  33.04 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  34.51 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  33.04 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.73 
 
 
389 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  34.71 
 
 
382 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.71 
 
 
382 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  34.58 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  31.78 
 
 
386 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  35.22 
 
 
383 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  34.81 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  33.24 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  32.75 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  34.51 
 
 
385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.84 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  31.55 
 
 
363 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  31.36 
 
 
357 aa  160  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  30.47 
 
 
381 aa  160  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.55 
 
 
387 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.15 
 
 
387 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  34.9 
 
 
382 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  35.84 
 
 
376 aa  159  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  33.06 
 
 
389 aa  159  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  30.24 
 
 
410 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  32.55 
 
 
386 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  32.65 
 
 
382 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  34.6 
 
 
382 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  32.65 
 
 
387 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  30.41 
 
 
410 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  30.61 
 
 
384 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>