More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0703 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  100 
 
 
357 aa  746    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  56.15 
 
 
358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  56.15 
 
 
358 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  49.16 
 
 
356 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  48.6 
 
 
356 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  49.72 
 
 
357 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  48.17 
 
 
357 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  47.9 
 
 
357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  45.94 
 
 
358 aa  338  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  46.91 
 
 
355 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  40 
 
 
360 aa  287  2e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  43.4 
 
 
362 aa  276  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  37.36 
 
 
370 aa  251  9.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  37.64 
 
 
373 aa  251  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  37.08 
 
 
375 aa  250  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  36.8 
 
 
370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  36.52 
 
 
370 aa  239  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  32.34 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.61 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.2 
 
 
383 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  32.55 
 
 
387 aa  192  8e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  31.66 
 
 
382 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  31.36 
 
 
382 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  33.43 
 
 
384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  32.27 
 
 
386 aa  190  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.04 
 
 
362 aa  189  9e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.77 
 
 
382 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  33.53 
 
 
385 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  30.99 
 
 
363 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  33.04 
 
 
362 aa  185  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  32.75 
 
 
362 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  31.36 
 
 
385 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  32.75 
 
 
384 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  30.25 
 
 
360 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  30.7 
 
 
384 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.28 
 
 
387 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  32.93 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  34.93 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  30.28 
 
 
382 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  30.28 
 
 
382 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  27.73 
 
 
388 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  29.23 
 
 
379 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.52 
 
 
380 aa  171  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.89 
 
 
387 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  29.72 
 
 
387 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  30.97 
 
 
383 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.31 
 
 
400 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  31.4 
 
 
376 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  29.83 
 
 
385 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  28.37 
 
 
384 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  30.62 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  28.37 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.57 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  30.62 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  31.36 
 
 
371 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  30.14 
 
 
384 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  31.36 
 
 
379 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  27.47 
 
 
379 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  31.12 
 
 
377 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  28.45 
 
 
390 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  31.23 
 
 
406 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  28.81 
 
 
395 aa  159  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  27.51 
 
 
381 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  30.03 
 
 
382 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  30.62 
 
 
385 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  28.91 
 
 
383 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  27.87 
 
 
379 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  29.89 
 
 
397 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  27.86 
 
 
379 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  30.88 
 
 
401 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  26 
 
 
379 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  29.71 
 
 
394 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  28.82 
 
 
386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  28.82 
 
 
381 aa  155  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  30.47 
 
 
406 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  28.45 
 
 
360 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  27.45 
 
 
380 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  28.69 
 
 
382 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  29.89 
 
 
396 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  30.14 
 
 
380 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  31.02 
 
 
406 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  30.88 
 
 
387 aa  153  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  30.47 
 
 
406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  29.18 
 
 
384 aa  152  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  28.49 
 
 
382 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  30.43 
 
 
391 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  29.74 
 
 
380 aa  149  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  28.69 
 
 
367 aa  149  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  28.04 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  29.64 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  31.12 
 
 
421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  28.17 
 
 
414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  30.14 
 
 
396 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  29.6 
 
 
398 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  30.26 
 
 
382 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  29.74 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  29.24 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  27.05 
 
 
395 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  28.08 
 
 
381 aa  145  9e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  27.46 
 
 
406 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>