More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1876 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  100 
 
 
373 aa  768    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  84.59 
 
 
370 aa  664    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  81.6 
 
 
375 aa  642    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  88.38 
 
 
370 aa  690    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  79.46 
 
 
370 aa  626  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  40.56 
 
 
360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  38.03 
 
 
356 aa  255  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  38.03 
 
 
356 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  38.59 
 
 
357 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  37.64 
 
 
357 aa  251  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  37.96 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  36.21 
 
 
358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  35.93 
 
 
358 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  37.95 
 
 
357 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  38.94 
 
 
358 aa  238  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  37.76 
 
 
355 aa  233  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  35.9 
 
 
362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  36.24 
 
 
382 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.03 
 
 
382 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  35.67 
 
 
382 aa  215  8e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  34.44 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  37.15 
 
 
387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.06 
 
 
362 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  34.77 
 
 
362 aa  208  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  34.77 
 
 
362 aa  207  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  32.68 
 
 
385 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  35.36 
 
 
383 aa  196  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  33.63 
 
 
383 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  33.05 
 
 
383 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  33.99 
 
 
363 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.43 
 
 
383 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  32.74 
 
 
384 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.93 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  32.27 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  31.46 
 
 
385 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.55 
 
 
381 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  32.41 
 
 
360 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  30.36 
 
 
388 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  32.49 
 
 
381 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.92 
 
 
387 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  31.27 
 
 
384 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  32.46 
 
 
382 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  32.46 
 
 
382 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.14 
 
 
380 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  32.66 
 
 
384 aa  176  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  30.92 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  33.7 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  33.14 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  30.45 
 
 
384 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  30.45 
 
 
384 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  31.79 
 
 
387 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  31.27 
 
 
377 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.7 
 
 
387 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  33.43 
 
 
381 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  30.7 
 
 
386 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  32.52 
 
 
401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  30.03 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  30.7 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  29.82 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  32.56 
 
 
370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  30.58 
 
 
385 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  32.36 
 
 
382 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  31.98 
 
 
404 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  31.91 
 
 
402 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  30.14 
 
 
385 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  31.91 
 
 
402 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  30.14 
 
 
385 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  31.62 
 
 
402 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  32.33 
 
 
388 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  31.49 
 
 
382 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.4 
 
 
400 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  32.79 
 
 
376 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  32.5 
 
 
417 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  31.58 
 
 
382 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  31.09 
 
 
402 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  31.75 
 
 
417 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  30.37 
 
 
390 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.2 
 
 
395 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  32.66 
 
 
400 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  28.61 
 
 
387 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  31.51 
 
 
396 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  31.49 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  28.93 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  29.32 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  28.93 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  28.98 
 
 
382 aa  153  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  28.53 
 
 
379 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  29.46 
 
 
381 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  30.66 
 
 
401 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  29.36 
 
 
376 aa  151  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  28.74 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  29.2 
 
 
375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  29.89 
 
 
415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  30.2 
 
 
421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.7 
 
 
381 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  28.11 
 
 
380 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  30.29 
 
 
391 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  30.61 
 
 
373 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  29.25 
 
 
401 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  29.12 
 
 
392 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>