More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5058 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  100 
 
 
381 aa  777    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  72.63 
 
 
381 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  74.13 
 
 
384 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  73.22 
 
 
375 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  73.79 
 
 
375 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  63.76 
 
 
394 aa  521  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  64.29 
 
 
394 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  62.11 
 
 
412 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  62.63 
 
 
412 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  65.1 
 
 
366 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  63.64 
 
 
394 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  58.99 
 
 
394 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  58.73 
 
 
394 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  59.58 
 
 
394 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  58.47 
 
 
394 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  52.33 
 
 
396 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  52.33 
 
 
396 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  52.33 
 
 
395 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  53.57 
 
 
392 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  49.86 
 
 
367 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  48.08 
 
 
388 aa  371  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  48.77 
 
 
401 aa  361  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  47.68 
 
 
404 aa  360  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  48.27 
 
 
380 aa  356  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  49.18 
 
 
377 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  47.61 
 
 
382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  48.63 
 
 
377 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  48.52 
 
 
376 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  47.04 
 
 
391 aa  351  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  48.63 
 
 
377 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  48.63 
 
 
377 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  47.98 
 
 
393 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  47.37 
 
 
413 aa  348  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  47.03 
 
 
375 aa  349  6e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  49.18 
 
 
372 aa  347  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  47.38 
 
 
369 aa  346  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.28 
 
 
377 aa  344  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  46.13 
 
 
380 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  48.35 
 
 
377 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  47.38 
 
 
373 aa  344  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  45.41 
 
 
396 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.08 
 
 
377 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  47.81 
 
 
379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  47.53 
 
 
378 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.08 
 
 
377 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.35 
 
 
377 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.44 
 
 
380 aa  339  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  47.12 
 
 
380 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  45.28 
 
 
378 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  45.01 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  48.24 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  45.58 
 
 
380 aa  336  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  42.74 
 
 
373 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  44.78 
 
 
373 aa  327  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  47.77 
 
 
370 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  43.87 
 
 
371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.61 
 
 
389 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  41.3 
 
 
455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  40.21 
 
 
415 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  40.26 
 
 
412 aa  289  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  39.69 
 
 
411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  38.28 
 
 
409 aa  285  9e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  37.96 
 
 
410 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  37.86 
 
 
413 aa  282  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  37.08 
 
 
426 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  38.9 
 
 
414 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  39.16 
 
 
451 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  39.16 
 
 
441 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  39.43 
 
 
414 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  36.55 
 
 
436 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  39.16 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  35.77 
 
 
406 aa  272  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  36.29 
 
 
406 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  37.43 
 
 
414 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  38.68 
 
 
418 aa  266  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  41.53 
 
 
384 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  38.4 
 
 
376 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  42.09 
 
 
312 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35 
 
 
382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.41 
 
 
382 aa  216  7e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  32.68 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  37.33 
 
 
371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  34.8 
 
 
363 aa  212  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  33.82 
 
 
382 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  33.53 
 
 
382 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  31.9 
 
 
410 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  36.21 
 
 
379 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  33.7 
 
 
414 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  31.84 
 
 
384 aa  206  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  34.08 
 
 
385 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  34.57 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.5 
 
 
387 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  33.06 
 
 
384 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  34.23 
 
 
381 aa  199  7e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  33.06 
 
 
384 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  35.83 
 
 
384 aa  199  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  37.87 
 
 
506 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  34.89 
 
 
385 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.89 
 
 
382 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.4 
 
 
383 aa  194  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>