More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1088 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  87.4 
 
 		 375 aa  675    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 370 aa  768    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  84.59 
 
 		 373 aa  664    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  85.68 
 
 		 370 aa  672    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  83.78 
 
 		 370 aa  656    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  40.85 
 
 		 360 aa  272  8.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  36.8 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  35.36 
 
 		 358 aa  242  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  36.9 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  34.65 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  35.08 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  34.65 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  36.54 
 
 		 357 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  38.24 
 
 		 358 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  37.17 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  35.98 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  35.11 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.27 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  34.83 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  35.98 
 
 		 387 aa  204  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  33.72 
 
 		 382 aa  202  8e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  32.86 
 
 		 362 aa  196  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.29 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  32.86 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.54 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 363 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  31.84 
 
 		 385 aa  186  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  31.87 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  32.65 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  30.92 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.01 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  32.58 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  32.68 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.2 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  31.4 
 
 		 386 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  29.72 
 
 		 383 aa  175  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  32.29 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  29.66 
 
 		 381 aa  172  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  32.94 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  31.65 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  31.65 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  31.79 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.28 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  30.81 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  30.58 
 
 		 367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.99 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  29.81 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  29.05 
 
 		 360 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  31.12 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  31.62 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  31.66 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  29.82 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  29.81 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  29.81 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  31.65 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  31.37 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  29.59 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  29.59 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  31.65 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  32.97 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  28.33 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  34.73 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.28 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  31.01 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  31.37 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  30.35 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  29.06 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  27.09 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  27.09 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  28.38 
 
 		 381 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  31.75 
 
 		 382 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.75 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  31.34 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  27.52 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  29.48 
 
 		 396 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  29.48 
 
 		 396 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  29.89 
 
 		 397 aa  149  8e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  29.83 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  29.75 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  28.73 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  27.78 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  30.97 
 
 		 415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  29.61 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  30.6 
 
 		 396 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  28.57 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  30.06 
 
 		 421 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  29.71 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  30.92 
 
 		 417 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  28.22 
 
 		 381 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  30.64 
 
 		 417 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  30.06 
 
 		 391 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  31.43 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.38 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  28.78 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  29.48 
 
 		 391 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  27.61 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  29.86 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  29.86 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  27.56 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>