More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0738 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  100 
 
 		 371 aa  743    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  84.66 
 
 		 379 aa  615  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  53.48 
 
 		 384 aa  364  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  42.03 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  42.03 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  41.76 
 
 		 395 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  38.4 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  40.62 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  41.32 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  38.89 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  35.89 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  36.46 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  36.44 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.09 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  35.17 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  35.34 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  38.11 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  37.33 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  37.82 
 
 		 375 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  36.29 
 
 		 373 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.81 
 
 		 377 aa  212  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  35.26 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  38.22 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  36.84 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  35.81 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  35.55 
 
 		 412 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.32 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  35.91 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  37.22 
 
 		 369 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  35.81 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  37.39 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  35.26 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  35.16 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  35.81 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  35.81 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  35.87 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  34.1 
 
 		 394 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.71 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.75 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.81 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  36.16 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  36.84 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.82 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  34.68 
 
 		 394 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  34.07 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  34.57 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  34.05 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  34.97 
 
 		 393 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.24 
 
 		 394 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  37.12 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  34.07 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  34.66 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  34.9 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  35.16 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  33.24 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  34.25 
 
 		 380 aa  199  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  35.34 
 
 		 379 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  34.25 
 
 		 396 aa  199  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  33.88 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  36.11 
 
 		 376 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  33.88 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  33.33 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  35.21 
 
 		 344 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.61 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.59 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  32.84 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  31.44 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  31.44 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  37.4 
 
 		 389 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.52 
 
 		 380 aa  182  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  33.99 
 
 		 312 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  35.79 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  35.52 
 
 		 383 aa  176  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  34.62 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  35.48 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  32.14 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.22 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  33.87 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  31.27 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  32.97 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  34.6 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  33.91 
 
 		 376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  33.63 
 
 		 385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  31.69 
 
 		 360 aa  166  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  35.48 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  32.94 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  31.56 
 
 		 384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  31.56 
 
 		 384 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  33.14 
 
 		 383 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  30.08 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  31.36 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  31.85 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  33.69 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  32.84 
 
 		 386 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.67 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  31.96 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  29.71 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  32.31 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>