More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3660 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  88.13 
 
 		 380 aa  680    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  96.82 
 
 		 378 aa  752    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  87.11 
 
 		 380 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  94.16 
 
 		 377 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  94.69 
 
 		 377 aa  738    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  85.49 
 
 		 379 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  94.16 
 
 		 377 aa  734    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  94.16 
 
 		 377 aa  734    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  94.43 
 
 		 377 aa  735    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  86.21 
 
 		 378 aa  669    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  87.6 
 
 		 380 aa  684    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  97.35 
 
 		 377 aa  752    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  100 
 
 		 377 aa  773    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  85.45 
 
 		 380 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  97.88 
 
 		 377 aa  739    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  83.02 
 
 		 376 aa  648    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  74.66 
 
 		 373 aa  581  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  72.78 
 
 		 373 aa  575  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  74.93 
 
 		 382 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  72.16 
 
 		 369 aa  566  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  72.7 
 
 		 373 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  73.91 
 
 		 372 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  70.92 
 
 		 393 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  69.89 
 
 		 375 aa  547  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  69.46 
 
 		 393 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  67.39 
 
 		 391 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  65.87 
 
 		 413 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  65.85 
 
 		 377 aa  518  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  66.18 
 
 		 344 aa  476  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  56.4 
 
 		 371 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  56.47 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  51.47 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  53.07 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  53.07 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  52.8 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  51.87 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  49.73 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  51.1 
 
 		 381 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  51.98 
 
 		 375 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  51.41 
 
 		 375 aa  351  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.08 
 
 		 381 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  51.5 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  55.85 
 
 		 312 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  47.33 
 
 		 412 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  47.33 
 
 		 412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.6 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  47.59 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.32 
 
 		 384 aa  332  6e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  44.74 
 
 		 394 aa  332  9e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.79 
 
 		 394 aa  332  9e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  46.79 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.94 
 
 		 394 aa  325  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.94 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  48.2 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.05 
 
 		 366 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.44 
 
 		 380 aa  315  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.99 
 
 		 389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  42.47 
 
 		 396 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  42.11 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  35.49 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  38.74 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  34.97 
 
 		 410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  35.38 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  35.49 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  36.27 
 
 		 436 aa  246  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  34.46 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  36.27 
 
 		 426 aa  242  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  35.92 
 
 		 414 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  35.92 
 
 		 414 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  34.78 
 
 		 441 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  38.69 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  35.46 
 
 		 414 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  34.78 
 
 		 451 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  35.11 
 
 		 413 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  35.75 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  35.14 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  35.66 
 
 		 418 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  36.94 
 
 		 382 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  35.83 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  35.83 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  33.79 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 406 aa  215  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  36.09 
 
 		 371 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.44 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  36.09 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  33.79 
 
 		 381 aa  212  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  34.08 
 
 		 410 aa  212  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  34.39 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  34.52 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  37.02 
 
 		 384 aa  209  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  35.69 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  35.28 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.33 
 
 		 382 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  34.33 
 
 		 382 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  33.89 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  34.07 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.19 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2556  aminotransferase class V  36.83 
 
 		 468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0828  aminotransferase, class V  36.11 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0287206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>