More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_10021 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  100 
 
 
394 aa  808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  88.07 
 
 
394 aa  728    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  86.55 
 
 
394 aa  717    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  87.06 
 
 
394 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  67.62 
 
 
412 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  68.15 
 
 
412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  65.89 
 
 
394 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  65.12 
 
 
394 aa  551  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  69.51 
 
 
366 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  64.51 
 
 
394 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  64.89 
 
 
384 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  59.58 
 
 
381 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  60.87 
 
 
381 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  60.97 
 
 
375 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  61.25 
 
 
375 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  46.56 
 
 
388 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  46.37 
 
 
401 aa  359  4e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  46.57 
 
 
404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  47.47 
 
 
367 aa  350  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  46.47 
 
 
380 aa  346  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  46.7 
 
 
377 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  46.83 
 
 
379 aa  343  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  44.95 
 
 
380 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  45.38 
 
 
380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  46.7 
 
 
377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  43.87 
 
 
413 aa  342  5e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  46.43 
 
 
377 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  46.43 
 
 
377 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  45.04 
 
 
378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  46.05 
 
 
380 aa  340  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  45.88 
 
 
377 aa  338  7e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  43.84 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  45.16 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  45.6 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  45.97 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  45.16 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.89 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  44.38 
 
 
382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  43.29 
 
 
391 aa  336  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  45.05 
 
 
378 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  45.33 
 
 
377 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  45.6 
 
 
377 aa  333  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  46.5 
 
 
369 aa  331  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  44.35 
 
 
393 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  44.38 
 
 
375 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  43.01 
 
 
393 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  43.01 
 
 
373 aa  328  9e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  44.51 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  43.6 
 
 
373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  45.45 
 
 
392 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  43.68 
 
 
396 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  41.92 
 
 
377 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  43.87 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  41.71 
 
 
380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  42.86 
 
 
371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  45 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  43.63 
 
 
389 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  35.48 
 
 
415 aa  276  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  36.36 
 
 
410 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  35.75 
 
 
411 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  36.68 
 
 
413 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  35.73 
 
 
412 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  37.05 
 
 
414 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  36.94 
 
 
409 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  36.69 
 
 
451 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  36.69 
 
 
441 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  34.55 
 
 
455 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  35.75 
 
 
414 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  36.68 
 
 
414 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  35.75 
 
 
414 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  36.07 
 
 
426 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  35.62 
 
 
406 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  33.42 
 
 
436 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  34.66 
 
 
406 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  36.75 
 
 
376 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  33.69 
 
 
418 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  40.4 
 
 
312 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  37.21 
 
 
384 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  33.82 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  36.84 
 
 
387 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  36.84 
 
 
387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.24 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  37.24 
 
 
385 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.96 
 
 
387 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  31.96 
 
 
410 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  35.86 
 
 
385 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.22 
 
 
384 aa  208  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  34.63 
 
 
384 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  34.78 
 
 
386 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  32.06 
 
 
382 aa  206  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  34.68 
 
 
371 aa  206  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  32.06 
 
 
382 aa  205  9e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  33.24 
 
 
414 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.39 
 
 
384 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  33.06 
 
 
379 aa  203  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.39 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  33.33 
 
 
385 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  34.39 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.45 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  33.63 
 
 
387 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>