More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0791 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2700  alanine--glyoxylate aminotransferase  82.54 
 
 		 404 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0791  aminotransferase class V  100 
 
 		 412 aa  837    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.644742 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0866  alanine--glyoxylate aminotransferase  82.79 
 
 		 404 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000382013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2047  alanine--glyoxylate aminotransferase  82.79 
 
 		 404 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000188057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3219  alanine--glyoxylate aminotransferase  82.79 
 
 		 404 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000141381  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3204  aminotransferase, class V  82.79 
 
 		 404 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745679  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3920  aminotransferase, class V  84.77 
 
 		 403 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84351  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  82.29 
 
 		 404 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0797  aminotransferase class V  84.77 
 
 		 403 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2424  aminotransferase class V  84.29 
 
 		 406 aa  680    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2556  aminotransferase class V  84.62 
 
 		 468 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1910  alanine--glyoxylate aminotransferase  82.54 
 
 		 404 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0577107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0724  aminotransferase class V  84.52 
 
 		 403 aa  670    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0344  aminotransferase, class V  85.28 
 
 		 403 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0707  aminotransferase, class V  84.52 
 
 		 403 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0828  aminotransferase, class V  85.28 
 
 		 403 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0287206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3165  aminotransferase, class V  82.79 
 
 		 404 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00663559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  68.25 
 
 		 410 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  60.62 
 
 		 414 aa  482  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  37.04 
 
 		 404 aa  253  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  37.4 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  35.98 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  35.08 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  34.49 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  36.17 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  34.71 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  34.82 
 
 		 380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  36.67 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  36.44 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  36.94 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  37.98 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  37.98 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  37.5 
 
 		 395 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  37.02 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  36.01 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  36.67 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  36.39 
 
 		 377 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  36.67 
 
 		 377 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.67 
 
 		 377 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  35.83 
 
 		 377 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.75 
 
 		 377 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.11 
 
 		 377 aa  205  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  33.06 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  32.56 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  34.64 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.87 
 
 		 377 aa  203  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.28 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  35.36 
 
 		 372 aa  203  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  34.89 
 
 		 367 aa  203  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  34.9 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  33.33 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  31.7 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  32.89 
 
 		 393 aa  199  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  31.94 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.68 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  32 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  37.43 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  35.16 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.1 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.78 
 
 		 394 aa  192  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.53 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.69 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.53 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  33.78 
 
 		 373 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  31.61 
 
 		 413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.25 
 
 		 394 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.1 
 
 		 412 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.85 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.82 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  32.36 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  32.48 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  33.06 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.53 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  31.49 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  34.72 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  32.24 
 
 		 344 aa  177  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.5 
 
 		 381 aa  170  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  30.21 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  30.51 
 
 		 360 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  32.86 
 
 		 362 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  33.14 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  33.93 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.2 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  29.02 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  26.82 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  33.71 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.43 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  31.09 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  30.12 
 
 		 410 aa  159  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  31.06 
 
 		 411 aa  159  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  32.23 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  32.81 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  30.91 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.58 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  32.56 
 
 		 384 aa  156  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  29.37 
 
 		 414 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.93 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.26 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  31.39 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  27.95 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>