More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0828 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0828  aminotransferase, class V  100 
 
 		 383 aa  773    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0406  aminotransferase class V  64.72 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.472989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  36.68 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44075  predicted protein  35.34 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05470  alanine-glyoxylate transaminase, putative  33.71 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01342  hypothetical alanine--glyoxylate aminotransferase (Eurofung)  31.71 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000773374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  34.21 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  30.51 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.03 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.77 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  32.28 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  33.51 
 
 		 382 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  33.51 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  30.29 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.33 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  35.37 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  32.47 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  32.47 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  30.83 
 
 		 384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  32.73 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  30.83 
 
 		 384 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  34.23 
 
 		 387 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  28.65 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  32.43 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  30.93 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  31.88 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  31.69 
 
 		 384 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.88 
 
 		 387 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  31.03 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  31.25 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  33.23 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.48 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  31.98 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  31.79 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  31.28 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  31.01 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  33.93 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.71 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  27.82 
 
 		 380 aa  167  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  30.05 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  30.55 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.53 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  32.07 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  34.33 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  31.05 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  33.03 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.63 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  31.25 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  29.1 
 
 		 381 aa  159  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  32.74 
 
 		 397 aa  159  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  31.66 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  31.3 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  32.52 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  30.23 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  32.47 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  30.69 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.45 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  32.73 
 
 		 382 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  28.49 
 
 		 391 aa  155  8e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  28.68 
 
 		 379 aa  155  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  30.85 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  28.18 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  32.18 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  31.31 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.55 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  31.78 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  30.14 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.75 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  30.29 
 
 		 382 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  32.21 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.06 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.13 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  28.7 
 
 		 396 aa  149  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  32.59 
 
 		 362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  28.02 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  32.99 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  30.54 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  30.52 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.89 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  31.16 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  30.03 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  32.59 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  31.31 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  29.46 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  30 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  31.62 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  32.98 
 
 		 381 aa  146  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  32.22 
 
 		 377 aa  146  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  30.54 
 
 		 363 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  31.32 
 
 		 367 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  29.65 
 
 		 391 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.11 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  32.63 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  28.95 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  30.06 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.95 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  29.72 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>