More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0835 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0835  alanine--glyoxylate transaminase  100 
 
 
384 aa  770    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389191  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1612  Serine--glyoxylate transaminase  73.11 
 
 
385 aa  569  1e-161  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  69.53 
 
 
389 aa  541  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0190  alanine--glyoxylate transaminase  47.71 
 
 
384 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0814206  normal  0.663999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  40.27 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0839  aminotransferase, class V  38.25 
 
 
380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.943478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0845  aminotransferase, class V  38.08 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00507503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2533  aminotransferase class V  39.39 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0855  aminotransferase class V  36.9 
 
 
375 aa  232  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  33.78 
 
 
382 aa  219  5e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1789  aminotransferase class V  37.94 
 
 
365 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.530358  normal  0.630477 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  32.64 
 
 
384 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  32.64 
 
 
384 aa  209  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  31.76 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  34.22 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  31 
 
 
382 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.22 
 
 
382 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  30.5 
 
 
382 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  30.75 
 
 
380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  32.11 
 
 
362 aa  196  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  33.77 
 
 
385 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  32.11 
 
 
362 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  31.67 
 
 
385 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  35.28 
 
 
384 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  31.02 
 
 
380 aa  193  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  31.54 
 
 
387 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.27 
 
 
362 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.58 
 
 
395 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  34.22 
 
 
388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  36.53 
 
 
383 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  30.87 
 
 
379 aa  186  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  30.81 
 
 
383 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  31.12 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  34.13 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  33.7 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  35.77 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  35.77 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  31.19 
 
 
391 aa  184  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  34.79 
 
 
367 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  32.6 
 
 
382 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  32.6 
 
 
382 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  29.79 
 
 
387 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.38 
 
 
400 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  31.87 
 
 
383 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  30.38 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4145  Serine--glyoxylate transaminase  34.96 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  33.16 
 
 
382 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  29.89 
 
 
387 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.43 
 
 
383 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  28.61 
 
 
384 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  33.06 
 
 
382 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  33.16 
 
 
393 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  33.51 
 
 
385 aa  179  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  28.61 
 
 
384 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  34.55 
 
 
392 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  31.41 
 
 
400 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.32 
 
 
387 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1702  aminotransferase class V  35.97 
 
 
361 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  29.56 
 
 
387 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  30.67 
 
 
391 aa  176  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  31.62 
 
 
393 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  32.06 
 
 
422 aa  176  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  30.56 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  34.29 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  32.14 
 
 
377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2203  Serine--pyruvate transaminase  33.96 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  30.54 
 
 
381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  29.55 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  32.45 
 
 
391 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  34.79 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  30.25 
 
 
375 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  31.59 
 
 
404 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  31.61 
 
 
382 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  32.35 
 
 
410 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  30.47 
 
 
396 aa  170  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  28.76 
 
 
396 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  28.57 
 
 
380 aa  169  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  32.06 
 
 
402 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2010  aminotransferase, class V  36.1 
 
 
388 aa  169  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  31.81 
 
 
402 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  32.75 
 
 
386 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  31.84 
 
 
389 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  36.6 
 
 
376 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2809  aminotransferase class V  31.69 
 
 
367 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  30.5 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  31.55 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  32.23 
 
 
382 aa  167  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.16 
 
 
380 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  34.32 
 
 
377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  28.12 
 
 
379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  26.39 
 
 
381 aa  166  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  30.81 
 
 
401 aa  166  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  30.2 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  32.78 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  32.02 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  27.15 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  29.92 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  30.39 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  30.79 
 
 
402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  27.68 
 
 
379 aa  163  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>