More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2533 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2533  aminotransferase class V  100 
 
 		 354 aa  709    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1789  aminotransferase class V  66.03 
 
 		 365 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.530358  normal  0.630477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0855  aminotransferase class V  60.05 
 
 		 375 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  41.78 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0839  aminotransferase, class V  39.72 
 
 		 380 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.943478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0845  aminotransferase, class V  39.44 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00507503  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0190  alanine--glyoxylate transaminase  39.5 
 
 		 384 aa  245  8e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0814206  normal  0.663999 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1612  Serine--glyoxylate transaminase  40.62 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0835  alanine--glyoxylate transaminase  39.39 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  40.22 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2809  aminotransferase class V  37.64 
 
 		 367 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2203  Serine--pyruvate transaminase  38.92 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  34.83 
 
 		 360 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  38.48 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1702  aminotransferase class V  37.6 
 
 		 361 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  34.21 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  32.87 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.56 
 
 		 387 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  34.26 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 388 aa  182  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  31.36 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.86 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  34.35 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  32.64 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.98 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.27 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2744  aminotransferase, class V  35.36 
 
 		 370 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  32.5 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  32.5 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  31.84 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  33.15 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  35.91 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  32.07 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  31.07 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  34.17 
 
 		 384 aa  173  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  30.59 
 
 		 384 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  29.41 
 
 		 386 aa  172  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  31.3 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  32.3 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.95 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  30.32 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  30.61 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  30.56 
 
 		 413 aa  169  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.3 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  28.57 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  31.01 
 
 		 386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  28.57 
 
 		 384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.03 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  33.06 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  34.81 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  30.62 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  30.08 
 
 		 382 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.23 
 
 		 384 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  31.92 
 
 		 375 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2010  aminotransferase, class V  33.05 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  31.04 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4145  Serine--glyoxylate transaminase  32.56 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.4 
 
 		 377 aa  160  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  29.94 
 
 		 384 aa  159  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.67 
 
 		 381 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.75 
 
 		 384 aa  159  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  31.64 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  31.48 
 
 		 362 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  31.2 
 
 		 362 aa  159  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  29.92 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  33.98 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  33.06 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  31.76 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  29.2 
 
 		 381 aa  156  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  30.43 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  31.71 
 
 		 379 aa  152  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  28.57 
 
 		 394 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.75 
 
 		 394 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  32.75 
 
 		 376 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  29.09 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  31.32 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.78 
 
 		 394 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  31.13 
 
 		 376 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  32.05 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  29.91 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.34 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  28.93 
 
 		 391 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  30.94 
 
 		 393 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  29.48 
 
 		 373 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.58 
 
 		 412 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.69 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  28.77 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.3 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.3 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  31.56 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  29.48 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  31.36 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  30.06 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  31.47 
 
 		 376 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  29.56 
 
 		 381 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  31.01 
 
 		 367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  29.12 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  29.25 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  29.56 
 
 		 370 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  28.57 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>