More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1612 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1612  Serine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 385 aa  783    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0835  alanine--glyoxylate transaminase  73.11 
 
 		 384 aa  589  1e-167  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  69.45 
 
 		 389 aa  536  1e-151  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0190  alanine--glyoxylate transaminase  48.8 
 
 		 384 aa  340  2e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0814206  normal  0.663999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  40.45 
 
 		 373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0839  aminotransferase, class V  38.19 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.943478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0845  aminotransferase, class V  37.91 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00507503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2533  aminotransferase class V  40.62 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0855  aminotransferase class V  35.5 
 
 		 375 aa  235  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1789  aminotransferase class V  36.61 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.530358  normal  0.630477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  33.69 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  32.61 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  32.9 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  37.24 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.07 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  32.72 
 
 		 385 aa  199  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4145  Serine--glyoxylate transaminase  35.22 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  33.6 
 
 		 385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  32.56 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  32.89 
 
 		 384 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  30.4 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.12 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  29.87 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.46 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  30.37 
 
 		 391 aa  186  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  32.18 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.77 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  32.26 
 
 		 363 aa  183  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  32.21 
 
 		 386 aa  182  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2010  aminotransferase, class V  35.92 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.75 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  32.12 
 
 		 390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.79 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  32.23 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.39 
 
 		 387 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.01 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.47 
 
 		 400 aa  180  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  31.98 
 
 		 402 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  29.84 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  31.61 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  29.47 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  33.51 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  30.56 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  30.38 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  29.74 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  30.14 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  31.98 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  29.83 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  28.76 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  30.14 
 
 		 362 aa  175  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  31.98 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  28.49 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  31.34 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  31.34 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1702  aminotransferase class V  36.44 
 
 		 361 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  31.44 
 
 		 396 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  31.44 
 
 		 396 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  32.93 
 
 		 382 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  32.45 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  29.06 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  31.03 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  30.03 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  33.87 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.14 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  31.62 
 
 		 394 aa  170  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  29.87 
 
 		 404 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  29.9 
 
 		 417 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2203  Serine--pyruvate transaminase  33.6 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  31.88 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  30.73 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  31.51 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  32.43 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  32.97 
 
 		 401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  29.38 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  31.52 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  31.87 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  29.27 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  29.1 
 
 		 394 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  28.12 
 
 		 396 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  28.42 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  30.58 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  30.05 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.02 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.02 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  30.53 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  31.82 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  29.6 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  29.97 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  33.07 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2809  aminotransferase class V  30.75 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  29.84 
 
 		 382 aa  159  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  29.13 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  29.8 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  29.8 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  30.75 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  30.75 
 
 		 377 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  29.92 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  28.31 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>