More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2010 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2010  aminotransferase, class V  100 
 
 		 388 aa  758    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4145  Serine--glyoxylate transaminase  45.97 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  35.88 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  32.43 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  30.35 
 
 		 382 aa  183  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0190  alanine--glyoxylate transaminase  36.9 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0814206  normal  0.663999 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1612  Serine--glyoxylate transaminase  36.03 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  31.47 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  29.13 
 
 		 384 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0835  alanine--glyoxylate transaminase  36.04 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  34.2 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0845  aminotransferase, class V  31.4 
 
 		 380 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00507503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2809  aminotransferase class V  35.57 
 
 		 367 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  37.57 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  33.93 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  35.98 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  30.03 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  32.82 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0839  aminotransferase, class V  30.03 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.943478  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  28.61 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2533  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18740  serine-pyruvate aminotransferase  37.89 
 
 		 361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0855  aminotransferase class V  33.15 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2203  Serine--pyruvate transaminase  35.61 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  32.37 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  29.28 
 
 		 385 aa  162  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  32.42 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6554  aminotransferase class V  41.81 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313236  normal  0.834248 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  28.32 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.35 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  32.06 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  32.06 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  27.46 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  35.35 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  31.75 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2744  aminotransferase, class V  34.52 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.02 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1789  aminotransferase class V  33.87 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.530358  normal  0.630477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.42 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  30.91 
 
 		 384 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  27.22 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6139  aminotransferase class V  39.24 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0484984 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  31.71 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  30.65 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  32.34 
 
 		 373 aa  149  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  27.94 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.28 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  29.9 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  28.69 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.02 
 
 		 383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  29.11 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  28.68 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  29.08 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  29.23 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  37.71 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  30.65 
 
 		 393 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  30.75 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  29.59 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1702  aminotransferase class V  33.61 
 
 		 361 aa  143  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  30 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  27.99 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  29.57 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  29.44 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  30 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  28.87 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  26.93 
 
 		 379 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  30.56 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  30.46 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.71 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.73 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  26.93 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  28.14 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  29.34 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  30.27 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  27.68 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  32.39 
 
 		 401 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  30.71 
 
 		 377 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  27.84 
 
 		 380 aa  136  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  29.61 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  29.82 
 
 		 375 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  30.48 
 
 		 412 aa  135  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  29.19 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  26.58 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.59 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  28.65 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  29.59 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  30.87 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  29.59 
 
 		 377 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  30.87 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  29.32 
 
 		 377 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  29.22 
 
 		 380 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  28.49 
 
 		 369 aa  133  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  32.88 
 
 		 392 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  29.46 
 
 		 377 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  27.3 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  28.86 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  30.43 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>