More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18740 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18740  serine-pyruvate aminotransferase  100 
 
 		 361 aa  684    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6554  aminotransferase class V  46.57 
 
 		 364 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313236  normal  0.834248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4145  Serine--glyoxylate transaminase  40.31 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6139  aminotransferase class V  46.15 
 
 		 364 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0484984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2010  aminotransferase, class V  38.02 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  29.09 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  29.43 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  26.35 
 
 		 386 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  29.05 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  31.09 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  30.26 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  27.99 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2533  aminotransferase class V  32.85 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  27.54 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  28.61 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  28.73 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  28.25 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  28.93 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  27.22 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  28.41 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.92 
 
 		 400 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  27.36 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  28.41 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  27.99 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  31.12 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  27.51 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0855  aminotransferase class V  31.83 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  27.27 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  27.47 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  29.73 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  30 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0845  aminotransferase, class V  24.3 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00507503  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2809  aminotransferase class V  31.16 
 
 		 367 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2203  Serine--pyruvate transaminase  31.72 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1789  aminotransferase class V  33.23 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.530358  normal  0.630477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  30.06 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  30.36 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0839  aminotransferase, class V  24.02 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.943478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  31.73 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  29.91 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  30.68 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  30.49 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  36.25 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  30.9 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  30.16 
 
 		 375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  29.97 
 
 		 382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0835  alanine--glyoxylate transaminase  32.22 
 
 		 384 aa  113  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.66 
 
 		 384 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  28.2 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  33.02 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  28.13 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  28.87 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  27.85 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  30 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  32.1 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  28.7 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  29.74 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  27.51 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  27.92 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  28.49 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  27.1 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  29.49 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  30.74 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  30.63 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  26.81 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  29.74 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  28.99 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  26.81 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  29.41 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  27.19 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  27.78 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  29.6 
 
 		 387 aa  106  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  32.14 
 
 		 388 aa  106  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  31.11 
 
 		 401 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  29.84 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  30.12 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0190  alanine--glyoxylate transaminase  27.79 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0814206  normal  0.663999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  29.41 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1702  aminotransferase class V  31.64 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  29.15 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  29.15 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  32.8 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2744  aminotransferase, class V  31.42 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.07 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  31.38 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  30.79 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  30.37 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  26.35 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  28.52 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  31.95 
 
 		 397 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  28.7 
 
 		 394 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  29.88 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  27.94 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  28.86 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  29.22 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  30.58 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  28.09 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  30.58 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  28.45 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>