More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6554 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6554  aminotransferase class V  100 
 
 		 364 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313236  normal  0.834248 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6139  aminotransferase class V  86 
 
 		 364 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0484984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18740  serine-pyruvate aminotransferase  47.04 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4145  Serine--glyoxylate transaminase  39.64 
 
 		 395 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2010  aminotransferase, class V  40.19 
 
 		 388 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0839  aminotransferase, class V  29.43 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.943478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0845  aminotransferase, class V  29.13 
 
 		 380 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00507503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  28.7 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 400 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  32.92 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  27.94 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  34.42 
 
 		 384 aa  142  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  27.19 
 
 		 382 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  29.25 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  26.33 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  30.7 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0835  alanine--glyoxylate transaminase  30.51 
 
 		 384 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  28.02 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  30.12 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  26.24 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.74 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  27.22 
 
 		 384 aa  136  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  26.89 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.34 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  31.46 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  28.4 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  31.79 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  33.76 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  28.08 
 
 		 383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  28.11 
 
 		 381 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  30.31 
 
 		 375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.13 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  32.64 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  32.38 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  32 
 
 		 385 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2533  aminotransferase class V  30.51 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  29.92 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1612  Serine--glyoxylate transaminase  27.45 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  30.29 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  30.29 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  31.08 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  28.1 
 
 		 360 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  28.01 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  31.04 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  24.01 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  32.34 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  31.4 
 
 		 412 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2203  Serine--pyruvate transaminase  33.54 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  29.06 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  23.88 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  29.06 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  29.5 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  31.73 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  28.66 
 
 		 356 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  32.22 
 
 		 412 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  25.21 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  27.91 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  30.63 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  28.21 
 
 		 356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  29.87 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  26.35 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  27.53 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  31.01 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  28.66 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  30.34 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  24.86 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  30.85 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  27.33 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  31.54 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.44 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  30.82 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  28.19 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  28.92 
 
 		 393 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  27.87 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  27.19 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  28.44 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  27.93 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  28.44 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  26.05 
 
 		 380 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  27.73 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  33.08 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  27.87 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  27.3 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  33.08 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  27.04 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  28.92 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.19 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  29.01 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0190  alanine--glyoxylate transaminase  27.87 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0814206  normal  0.663999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  27.76 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  30.47 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  24.93 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  30.69 
 
 		 371 aa  106  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  30.69 
 
 		 376 aa  105  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  29.41 
 
 		 382 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  27.82 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  32.7 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>