More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0845 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0845  aminotransferase, class V  100 
 
 		 380 aa  778    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00507503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0839  aminotransferase, class V  96.84 
 
 		 380 aa  759    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.943478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  50 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0835  alanine--glyoxylate transaminase  38.08 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2533  aminotransferase class V  39.44 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  36.71 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1612  Serine--glyoxylate transaminase  37.91 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0855  aminotransferase class V  37.77 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1789  aminotransferase class V  38.98 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.530358  normal  0.630477 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0190  alanine--glyoxylate transaminase  36.76 
 
 		 384 aa  222  8e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0814206  normal  0.663999 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  34.23 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  33.42 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4145  Serine--glyoxylate transaminase  31.81 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  33.15 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.61 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  34.49 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  33.06 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.06 
 
 		 384 aa  199  9e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.24 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.88 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  32.33 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  32.07 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.07 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  33.14 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  32.07 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  32.97 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  31.77 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  32.97 
 
 		 384 aa  189  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  30.98 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  33.07 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  29.32 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  29.67 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  31.44 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  30.21 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  30.68 
 
 		 373 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  30.33 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  29.59 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  28.93 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  30.73 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  31 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  29.57 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  29.57 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  29.97 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.67 
 
 		 377 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.51 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  29.35 
 
 		 404 aa  176  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.67 
 
 		 377 aa  176  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  31.76 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  32.7 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  30.92 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  32.03 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  29.2 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2809  aminotransferase class V  30.85 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  29.43 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.18 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  30.29 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  29.4 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  29.48 
 
 		 377 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  29.2 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  28.69 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  29.32 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  28.45 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  30.03 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  29.12 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.73 
 
 		 387 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  29.27 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  28.22 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2010  aminotransferase, class V  32.81 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.28 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  28.34 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2203  Serine--pyruvate transaminase  32.97 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  30.85 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  28.93 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  29.28 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  29.32 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  27.57 
 
 		 413 aa  169  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  29.35 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  28.85 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  28.88 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  30.66 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  29.26 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  28.77 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  28.3 
 
 		 391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  29.26 
 
 		 391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  29.26 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  30.41 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  27.59 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  31.37 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  30 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  28.7 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  28.76 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  27.79 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  29.17 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  28.61 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  30.22 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  27.51 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  29.41 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  27.99 
 
 		 380 aa  162  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.72 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  27.6 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>